[SCore-users-jp] ノード数とコア数が不一致

[vqm_mp]

鈴木です．大変お世話になっております．ありがとう
ございます．

 
> この場合, ハードウエア構成よりもソフトウエア構成
> (どうやってどこに mpich をインストールし,
> コンパイル/実行したか) のほうが重要なんですが...

すべて，デフォルトです．OSをインストールしなおし，
まっさらの状態でr系コマンドの設定をし，
　# ./configure
　# make
　# make install
としました．パスを通して実行しております．

> SCore の例にある hello.cc は MPC++ で書かれた
> もので MPI ではコンパイルできないはずです.
> mpich-1.2.7p1 に hello++.cc というのがありますが,
> こちらでしょうか?
> (MPI のテストでしたら hostname も出力されるので,
> cpi のほうが良いと思いますけど...)

hello++.ccのほうで試しました．


次の表は，以下のように訂正させてください．
> >   <host_num>  実際に動いたコア数
> >       2               2
> >       3               4
> >       4               6
> >       5               8
> >       6              10
> >       7              12
> 
> どのような実行結果が出てこのように判断したのかが不明な
のですが
> 具体的にたとえば 3
> の場合の出力がどうなっているのかがわからないと...

この表は，実際にhello++.ccを動かし，各ノードにおいて
topコマンド，psコマンドを使ってa.outが動いているかを
調べました．

cpi.cを動かしたときの出力結果は以下の通りです．

machineファイル：
comp01.pccluster.org:2
comp02.pccluster.org:2
#".org"の後ろの":2"を取り除いて動かしても，まったく同じ
症状

[root ＠ server mpi_test]# mpirun -np 4 ./a.out
Process 0 on server.pccluster.org
Process 2 on comp02.pccluster.org
Process 3 on comp01.pccluster.org
Process 0 on comp01.pccluster.org
pi is .....略

[root ＠ server mpi_test]# mpirun -np 3 ./a.out
Process 0 on server.pccluster.org
Process 1 on comp01.pccluster.org
Process 2 on comp02.pccluster.org
pi is .....略

同様にtop,psで調べると，<host_num>=4の場合は
　server*2+comp01*4+comp02*2
だけCPUが動き，<host_num>=3の場合は，
　server*2+comp01*2+comp02*2
のCPUが動いております．<host_num>と稼動コア数は
   稼動コア数 = 2*<host_num>
です．サーバーホストでもa.outが動いていることを
見逃していました．

   <host_num>  実際に動いたコア数
       2               4
       3               6
       4               8
       5              10
       6              12
       7              14


smpを使用しないで1CPUとしてOSを起動したときは，1CPUに
２つのa.outが走り，サーバーホストも加わって，
　　　a.outの数 = 2*<host_num>
となっています．

・2倍のCPUを使ってしまうのはなぜでしょうか？
・サーバーホスト(mpirunコマンドを打ち込むホスト)も計算に
　加わっていますが，これはMPIの仕様でしょうか？
・machineファイルの":2"は何を意味しているのでしょうか？


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