From ri002044 ＠ ed.ritsumei.ac.jp Mon Nov 2 18:26:58 2009 From: ri002044 ＠ ed.ritsumei.ac.jp (KAMEI YUUSUKE) Date: Mon, 02 Nov 2009 18:26:58 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] =?iso-2022-jp?b?GyRCMnI3aBsoQiAbJEIlRyViJEcbKEI=?= =?iso-2022-jp?b?GyRCJE4bKEJYSU8gZXJyb3I=?= In-Reply-To: <4AEA30BC.7050400@pccluster.org> References: <1256817355.16446.ri002044@ed.ritsumei.ac.jp> <4AEA30BC.7050400@pccluster.org> Message-ID: <1257154018.32612.ri002044@ed.ritsumei.ac.jp> 立命館大の亀井です。 亀山様ありがとうございます。 >>>>> score7-src/SCore/scout/local/xrelay.c に添付ファイルの patch を当てて >>>>> scout を compile してみてください. >>>> 私がインストールしたSCoreの Version は 6.0.2 ですので、 >>>> そのような directory はありません。 >>> すみません. >>> SCore6 の場合は >>> Score6-src/SCore/scored/lib/fep/xrelay.c >>> を同様にいじる必要があります. >>> この関数の >>> fork_xrelay() >>> の score_connect() を xserver_host が自分自身のときに >>> unix domain を使うようにすれば良いのですが... >> >> こちらの方法ですが、 >> 上記の directory、それに似た directory やファイルも存在しませんでした。 > >こちらは, source の tar file を持ってきて修正してコンパイル >し直す必要があります. > > http://www.pccluster.org/score_doc/score-6.0.2/html/ja/installation/download-source.html >にコンパイルの仕方を掲載しています. >(更に, 修正には若干の UNIX network programing の知識が必要に >なります.) > わかりました。こちらも検討しようと思います。 ありがとうございます。 From ishikawa ＠ is.s.u-tokyo.ac.jp Thu Nov 5 23:23:19 2009 From: ishikawa ＠ is.s.u-tokyo.ac.jp (ishikawa) Date: Thu, 05 Nov 2009 23:23:19 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] =?iso-2022-jp?b?GyRCQmgjOTJzGyhCIFBDGyRCJS8bKEI=?= =?iso-2022-jp?b?GyRCJWklOSU/JTclcyVdJTglJiVgJE4kNDBGRmIbKEI=?= Message-ID: <20091105.232319.229736669.ishikawa@is.s.u-tokyo.ac.jp> SCore usersの皆様、 12月10日〜11日に開催される第９回PCクラスタシンポジウムのご案内をお送り します。 今回は、PCクラスタから基盤センタースパコン、次世代スパコンにつながる話 題が満載です。 また、SCore標準配布に、文部科学省プロジェクトの一つである「シームレス高 生産・高性能プログラミング環境」の成果の一部が統合されています。今後の SCoreパッケージにもご注目下さい。 シンポジウムは事前登録制で、12月3日まで受け付けております。 皆様のご参加をお待ちして居ります。 石川 ============================================================= 第九回PCクラスタシンポジウム ------------------------------------------------------------- 【開催趣旨】 　科学技術の発展のためには、大規模計算科学シミュレーションが　必要不可 欠であり、PCクラスタは計算科学へのゲートウェイです。　PCクラスターコン ソー シアムでは、産業界、アカデミック界と連携して、計算科学へのゲートウェ イであるPCクラスタの普及に努めてきております。　　本シンポジウムでは、 プラットフォームなどのPCクラスタに関する　最新状況に加え、国内センター が有するスパコンの使われ方の一例を　示しながら、今後の計算科学に対する 支援方法について議論します。 【開催日程】2009年12月10日(木)、11日(金) 【開催場所】秋葉原コンベンションホール (秋葉原ダイビル2階) http://www.akibahall.jp/data/access.html 【定員】200名（ 事前登録制12月3日（木）まで） 以下のURLからお申し込み下さい。 　http://www.pccluster.org/ja_event/2009/10/pc-1.html 【プログラム】 　12月10日(木) 　　10：00〜10：05　オープニング 　　　　　　　　　　　石川 裕、PCクラスタコンソーシアム会長（東京大学） 　　10：05〜10：55　（招待講演）「日本原子力機構におけるスーパーコンピューティング」 　　　　　　　　　　　武宮 博、日本原子力研究開発機構 　　10：55〜11：35　（招待講演）「東北大学大規模科学計算システムの運用とベクトル 　　　　　　　　　　　　　　　　コンピューティングに関する研究開発」 　　　　　　　　　　　小林 広明、東北大学 サイバーサイエンスセンター 　（11：35〜13：05　昼休み） 　　13：05〜13：40　SCore最新状況 　　　　　　　　　　　堀 敦史、PCクラスタコンソーシアム（東京大学/筑波大学） 　　13：40〜14：10　クラスタ監視ソフトVGXPの開発・運用を通しての評価と課題 　　　　　　　　　　　鴨志田 良和、東京大学情報基盤センター 　　14：10〜14：40　MPI-Adapter: MPIバイナリ互換を実現するミドルウェア 　　　　　　　　　　　住元 真司、富士通研究所 　　14：40〜15：10　XcalableMP：超スケーラブルな並列化を支援するプログラミング言語 　　　　　　　　　　　坂上 仁志、核融合科学研究所 　（15：10〜15：50　ブレーク） 　　15：50〜16：20　PCクラスタプラットフォーム動向（仮題） 　　　　　　　　　　　池井　満、インテル株式会社 　　16：20〜16：50　AMDのHPCへの取り組み −最新テクノロジーアップデート− 　　　　　　　　　　　山野 洋幸、日本AMD株式会社 　　16：50〜17：30　プログラミングコンテスト結果報告 司会：鴨志田良和、東京大学情報基盤センター 1) 課題の狙い 中島 研吾、東京大学 情報基盤センター 2) 優秀者による発表 　12月11日(金) 　　10：00〜10：10　PCクラスタコンソーシアムご紹介 　　　　　　　　　　　石川　裕、PCクラスタコンソーシアム会長（東京大学） 　　10：10〜11：55　企業発表 　　　　　　　　　　・株式会社日立製作所　清水 正明 　　　　　　　　　　　「日立のテクニカルコンピューティングへの取り組み」 　　　　　　　　　　・富士通株式会社/株式会社富士通研究所　久門 耕一 　　　　　　　　　　　「富士通のＰＣクラスタへの取り組み（仮題）」 　　　　　　　　　　・株式会社HPCソリューションズ 　　　　　　　　　　・株式会社ベストシステムズ　島袋 慶悟 　　　　　　　　　　　「新しく発売されるPGIコンパイラ10.0について（仮題）」 　　　　　　　　　　・三菱プレシジョン株式会社　菊川 孝明 　　　　　　　　　　　「ＧＰＵクラスタの手術シミュレータへの応用」 　　　　　　　　　　・日本電気株式会社　広瀬 哲也 　　　　　　　　　　　「大規模クラスタ向けファイルシステムソリューション(LXFS)」 　　　　　　　　　　・住商情報システム株式会社　松川　幸平 　　　　　　　　　　　「SSS（ソリッド・ステート・ストレージ）の概要と現状について」 　（11：55〜13：25　昼休み） 　　13：25〜14：15　（招待講演）「次世代スーパーコンピュータへの期待」 　　　　　　　　　　　平尾 公彦、理化学研究所 計算科学研究機設立準備室長 　（14：15〜14：45　ブレーク） 　　14：45〜17：20　パネル討論「PCクラスタから次世代スパコンへ ? アカデミックと企業連携のあり方 ?」 司会：石川裕、東京大学 パネリスト： 　　　　　　　　　　　平尾 公彦、理化学研究所 計算科学研究機設立準備室長 　　　　　　　　　　　中島 研吾、東京大学 情報基盤センター 　　　　　　　　　　　堀　 敦史　PCクラスタコンソーシアム(東京大学/筑波大学) 　　　　　　　　　　　高田 俊和、理化学研究所 　　　　　　　　　　　高原 浩志、日本電気 　　　　　　　　　　　清水 正明、日立製作所 　　　　　　　　　　　久門 耕一、富士通研究所 　　17：20　　　　　クロージング 　　17：30〜　　　　懇親会(会費1,000円)、コンテスト優秀者表彰 【企業展示】 　・株式会社アックス 　・株式会社HPCソリューションズ 　・住商情報システム株式会社 　・日本AMD株式会社 　・日本電気株式会社 　・株式会社日立製作所 　・富士通株式会社 　・株式会社富士通九州システムズ 　・株式会社ベストシステムズ ============================================================= From spc ＠ kinjo.dyndns.info Thu Nov 19 13:49:52 2009 From: spc ＠ kinjo.dyndns.info (=?iso-2022-jp?b?c3BjIBskQiF3GyhCIGtpbmpvLmR5bmRucy5pbmZv?=) Date: Thu, 19 Nov 2009 13:49:52 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] =?iso-2022-jp?b?U2NvcmU3IGJldGEzIBskQiRLJEQbKEI=?= =?iso-2022-jp?b?GyRCJCQkRhsoQg==?= Message-ID: 金城大学短期大学部の池と申します。 昨日、１１月１８日に"Score7 beta3"がページ上にあがっておりましたがダウンロー ドできませんでした。 URLの最初のbeta2はもしかするとbeta3ではないでしょうか？ ↓ "http://www.pccluster.org/downloads/score-7-beta2/score-7-beta3-centos5.3.iso" また、ドキュメントはbeta2と変わりはないのでしょうか？よろしくお願いします。 ---- spc ＠ kinjo.dyndns.info From kameyama ＠ pccluster.org Fri Nov 20 02:25:29 2009 From: kameyama ＠ pccluster.org (Kameyama Toyohisa) Date: Fri, 20 Nov 2009 02:25:29 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] =?iso-2022-jp?b?U2NvcmU3IGJldGEzIBskQiRLJEQbKEI=?= =?iso-2022-jp?b?GyRCJCQkRhsoQg==?= In-Reply-To: References: Message-ID: <58505.140.221.192.41.1258651529.risu@postman.riken.jp> 亀山です. On 2009年 11月 19日 (木) 1:49 pm, spc ＠ kinjo.dyndns.info said: > 金城大学短期大学部の池と申します。 > > 昨日、１１月１８日に"Score7 beta3"がページ上にあがっておりましたがダウンロー > ドできませんでした。 > URLの最初のbeta2はもしかするとbeta3ではないでしょうか？ > ↓ > "http://www.pccluster.org/downloads/score-7-beta2/score-7-beta3-centos5.3.iso" すみません, 修正しました. > また、ドキュメントはbeta2と変わりはないのでしょうか？よろしくお願いします。 ドキュメントのほうも見えるようにしました. Kameyama Toyohisa From spc ＠ kinjo.dyndns.info Mon Nov 30 14:33:59 2009 From: spc ＠ kinjo.dyndns.info (=?iso-2022-jp?b?c3BjIBskQiF3GyhCIGtpbmpvLmR5bmRucy5pbmZv?=) Date: Mon, 30 Nov 2009 14:33:59 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] =?iso-2022-jp?b?U2NvcmU3YmV0YTMgGyRCISEbKEJERUxM?= =?iso-2022-jp?b?GyRCJEckTklUNnE5ZxsoQg==?= Message-ID: <23e0d81af23d99976a6c050f5547dab1.squirrel@kinjo.dyndns.info> こんにちは金城大学短期大学部の池恵と申します。 現在SCore7beta3を用いて大学のコンピュータ教室にクラスタを構成しようとしてい ます。RPMからインストールしたのですが、いくつかの問題が発生しました。 使用ハード：DELL OPTIPLEX GX620(ミニタワー) NIC：Broadcom 5751 10/100/1000 Ethernet 一台をサーバーにし二台をホストにして行っています。 (1)インストール時に以下のようなエラーが発生します。 ↓ build kernel modules for 2.6.18-128.el5/opt/score/7.Beta.3/install/linux2.6/ make_modules: line 11: cd: ethernhxb_mem: そのような>ファイルやディレクトリ はありません /opt/score/7.Beta.3/install/linux2.6/make_modules:line11:cd:pmx_etherhxb_mem : そのようなファイルやディレクトリはありません NICドライバは、正しくできているように見えますので、あまり大きな問題では ないと思いましたが、以下のとおりNICまわり(?)の問題が起こります。 (2)起動時にsctpで以下のようなエラーが発生します(以下、dmesg) ↓ SCTP: Hash tables configured (established 65536 bind 65536) Module sctp cannot be unloaded due to unsafe usage in net/sctp/protocol.c:1228 (3)ドキュメントにあるHelloプログラムを実行すると、hostの/var/log/messagesに 以下のような表示がずっと出続けます。 ↓ Nov 26 13:22:42 jack06 kernel: xmitframe no slot ffff810023e10070(0, 0) Nov 26 13:22:42 jack06 kernel: xmitframe no slot ffff810023e10070(1, 0) Nov 26 13:22:42 jack06 kernel: xmitframe no slot ffff810023e10070(0, 0) ちなみに、各ホストでは、a.out がそれぞれ動いています。 また、１台のホストだけの場合、問題はありません。 (4)姫野ベンチを実行したらフリーズしてしまいます。 ↓ Nov 27 11:06:43 jack05 kernel: tg3_pmx: eth0: BUG! Tx Ring full when queue awake! Nov 27 11:06:43 jack05 kernel: tg3_pmx: eth0: The system may be re-ordering memory-mapped I/O cycles to the network device, attempting to recover. Please report the problem to the driver maintainer and include system chipset information. Nov 27 11:06:43 jack05 kernel: tg3_pmx: eth0: Link is down. 以上から、NICドライバの問題と思われますが、どのように対処すればよろしいでしょ うか？ (間違いなく対応しているNICを付けてやり直すなど？) ご多忙かと存じますがご教授のほどよろしくお願い申し上げます。 金城大学短期大学部　池恵 spc ＠ kinjo.dyndns.info From kameyama ＠ pccluster.org Mon Nov 30 15:47:56 2009 From: kameyama ＠ pccluster.org (Kameyama Toyohisa) Date: Mon, 30 Nov 2009 15:47:56 +0900 Subject: [SCore-users-jp] =?iso-2022-jp?b?U2NvcmU3YmV0YTMgGyRCISEbKEJERUxM?= =?iso-2022-jp?b?GyRCJEckTklUNnE5ZxsoQg==?= In-Reply-To: <23e0d81af23d99976a6c050f5547dab1.squirrel@kinjo.dyndns.info> References: <23e0d81af23d99976a6c050f5547dab1.squirrel@kinjo.dyndns.info> Message-ID: <4B136A9C.3010304@pccluster.org> 亀山です. spc ＠ kinjo.dyndns.info Wrote: > (1)インストール時に以下のようなエラーが発生します。 > ↓ > build kernel modules for 2.6.18-128.el5/opt/score/7.Beta.3/install/linux2.6/ > make_modules: line 11: cd: ethernhxb_mem: そのような>ファイルやディレクトリ > はありません > /opt/score/7.Beta.3/install/linux2.6/make_modules:line11:cd:pmx_etherhxb_mem > : そのようなファイルやディレクトリはありません > NICドライバは、正しくできているように見えますので、あまり大きな問題では > ないと思いましたが、以下のとおりNICまわり(?)の問題が起こります。 現在使用している kernel が 2.6.18-128.el5 でなければ問題ありません. > (2)起動時にsctpで以下のようなエラーが発生します(以下、dmesg) > ↓ > SCTP: Hash tables configured (established 65536 bind 65536) > Module sctp cannot be unloaded due to unsafe usage in > net/sctp/protocol.c:1228 正常動作です. sctp は rmmod できないと言っているだけです. > (3)ドキュメントにあるHelloプログラムを実行すると、hostの/var/log/messagesに > 以下のような表示がずっと出続けます。 > ↓ > Nov 26 13:22:42 jack06 kernel: xmitframe no slot ffff810023e10070(0, 0) > Nov 26 13:22:42 jack06 kernel: xmitframe no slot ffff810023e10070(1, 0) > Nov 26 13:22:42 jack06 kernel: xmitframe no slot ffff810023e10070(0, 0) > > ちなみに、各ホストでは、a.out がそれぞれ動いています。 > また、１台のホストだけの場合、問題はありません。 > > > (4)姫野ベンチを実行したらフリーズしてしまいます。 > ↓ > Nov 27 11:06:43 jack05 kernel: tg3_pmx: eth0: BUG! Tx Ring full when queue > awake! > Nov 27 11:06:43 jack05 kernel: tg3_pmx: eth0: The system may be > re-ordering memory-mapped > I/O cycles to the network device, attempting to recover. Please report the > problem to the > driver maintainer and include system chipset information. > Nov 27 11:06:43 jack05 kernel: tg3_pmx: eth0: Link is down. とりあえず, network を変更したら動きませんでしょうか? scrun -network=ethernet ... で network を ethernet に指定できます. Kameyama Toyohisa