pythonMPI (Re: [SCore-users-jp] はじめまして)

[Kazuyuki Nakazono]

亀山様

中園です。

下記のとおりに実装を行い、こちらでも成功いたしました。
また、scrun pyMPI fractal.py も実行できました。

ご助力、本当にありがとうございました。



On Thu, 24 May 2007 17:15:37 +0900
Kameyama Toyohisa <kameyama ＠ pccluster.org> wrote:

> 亀山です.
> 
> Kazuyuki Nakazono さんは書きました:
> > いろいろ Version を入れ替えて試してみたところ、
> > Score-D 5.4.0
> > pyMPI-1.3.a1
> > python 2.5
> 
> > の組み合わせで、テストプログラムが実行できました。
> 
> こちらでも, SCore 5.6.1, redhat 8 (python 2.2.1), pyMPI 1.3a1 で
> 成功しました.
> 
> configure は
>     CC=mpicc CFLAGS=-nostatic ./configure --prefix=/home04/kameyama/pympi1
> にしました.
> python のほうが dynamic load を前提としているため,
> mpicc に -nostatic をつけて static link しないようにしました.
> (SCore 6 は static link しないほうが default になっています.)
> 
> > # fractal.py は python 側でエラーとなりましたが、
> > # Score は abort しませんでした
> 
> local で動いて
>     scrun pyMPI fractal.py
> で動かない場合は, server と compute host で python の
> version が違っているのかも知れません.
> configure のときに
>      PYTHON=/usr/bin/python ... ./configure ...
> と python を指定して configure を実行すると動きました.
> 
> INSTALL ファイルに書いてある
>     --with-python=/usr/bin/python
> ではうまく行きませんでした.
> 
> Kameyama Toyohisa
> 

_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/
中園一幸<nakazono ＠ src.riken.jp>
独立行政法人 理化学研究所 
遺伝子多型研究センター
統計解析研究チーム(Team SG)

TEL:03-5449-5708
FAX:03-5449-5564
_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/