From kameyama ＠ pccluster.org Fri Mar 2 14:42:51 2007 From: kameyama ＠ pccluster.org (Kameyama Toyohisa) Date: Fri, 02 Mar 2007 14:42:51 +0900 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] SCore 6.0.2.1 is released. Message-ID: <45E7B95B.2020908@pccluster.org> We are happy to announce the SCore 6.0.2 release. Please visit the following URL to obtain the package. http://www.pccluster.org/score/dist/ Sorry, Nobody can compile the scored command on SCore 6.0.2. And the scored command dose not include binary rpm on SCore 6.0.2. SCore 6.0.2.1 fixed the bug. Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From dclarke ＠ blastwave.org Fri Mar 2 15:25:06 2007 From: dclarke ＠ blastwave.org (Dennis Clarke) Date: Fri, 2 Mar 2007 01:25:06 -0500 (EST) Subject: [SCore-users-jp] Re: [SCore-users] SCore 6.0.2.1 is released. In-Reply-To: <45E7B95B.2020908@pccluster.org> References: <45E7B95B.2020908@pccluster.org> Message-ID: <38650.72.39.216.186.1172816706.squirrel@mail.blastwave.org> > We are happy to announce the SCore 6.0.2 release. Please visit the > following URL to obtain the package. > http://www.pccluster.org/score/dist/ > nothing for Solaris ? -- Dennis Clarke _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From carsten.ochtrup ＠ eds.com Tue Mar 6 03:18:29 2007 From: carsten.ochtrup ＠ eds.com (Ochtrup, Carsten) Date: Mon, 5 Mar 2007 19:18:29 +0100 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] Re: SCore 6.0.2.1 is released In-Reply-To: <20070303030003.D1069D02F3@www.pccluster.org> References: <20070303030003.D1069D02F3@www.pccluster.org> Message-ID: <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA1519D@derum200.emea.corp.eds.com> Hallo, as I have an 64bit Opteron cluster I tried to build SCore 6.0.2.1 from the sources with Suse 9.3. I have some problems creating the pm_ethernet device. In line 78 of the pm_ethernet start script pm_ethernet waits for /dev/etherpm/0. I do not have these devices, but instead I have /dev/etherpmII-0. I can modprobe all modules without problems. With SCore 5.8.3 I was able to build the devices with mkpmethernetdev. I tried change_ethernetdriver and rebooted the system, but no effect. BTW: there is a little typing error in line 113 of the scorehost.skel: #define ETHERNETGROUP group=_scoreall_.pcc,ethergroup In this line between _scoreall_ and pcc is a dot and not a comma. #define ETHERNETGROUP group=_scoreall_,pcc,ethergroup Mit freundlichen Gruessen / Best regards Carsten Ochtrup _________________ Engineering Systems Development & Support EDS Operation Services GmbH Eschenweg 11 15827 Blankenfelde-Mahlow Tel.: +49-33708-6-1684 Fax: +49-33708-6-511684 mailto:carsten.ochtrup ＠ eds.com From: Kameyama Toyohisa Subject: [SCore-users] SCore 6.0.2.1 is released. To: "score-users ＠ pccluster.org" Message-ID: <45E7B95B.2020908 ＠ pccluster.org> Content-Type: text/plain; charset=ISO-2022-JP We are happy to announce the SCore 6.0.2 release. Please visit the following URL to obtain the package. http://www.pccluster.org/score/dist/ Sorry, Nobody can compile the scored command on SCore 6.0.2. And the scored command dose not include binary rpm on SCore 6.0.2. SCore 6.0.2.1 fixed the bug. Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From kameyama ＠ pccluster.org Tue Mar 6 10:05:30 2007 From: kameyama ＠ pccluster.org (Kameyama Toyohisa) Date: Tue, 06 Mar 2007 10:05:30 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: [SCore-users] Re: SCore 6.0.2.1 is released In-Reply-To: <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA1519D@derum200.emea.corp.eds.com> References: <20070303030003.D1069D02F3@www.pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA1519D@derum200.emea.corp.eds.com> Message-ID: <45ECBE5A.2040205@pccluster.org> Ochtrup, Carsten wrote: > I have some problems creating the pm_ethernet device. > > In line 78 of the pm_ethernet start script pm_ethernet waits for > /dev/etherpm/0. > I do not have these devices, but instead I have /dev/etherpmII-0. If their are the following modules in /lib/modules/`uname -r`/extra/score+pm/ on the your compute hosts, please remove them: pm_ethernet2.ko, e1000_scorepm2.ko, tg3_scorepm2.ko and pm_ethernet2_mem.ko And reboot the compute hosts. > I can modprobe all modules without problems. Please send the list of /lib/modules/`uname -r`/extra/score+pm/, the output of /sbin/lsmod, and output to dmesg on your compute hosts. > With SCore 5.8.3 I was able to build the devices with mkpmethernetdev. I > tried change_ethernetdriver and rebooted the system, but no effect. Please send the contents of /etc/modprobe.conf and the output of /opt/score/install/linux2.6/netdev -a. > BTW: there is a little typing error in line 113 of the scorehost.skel: > > #define ETHERNETGROUP group=_scoreall_.pcc,ethergroup > > In this line between _scoreall_ and pcc is a dot and not a comma. > > #define ETHERNETGROUP group=_scoreall_,pcc,ethergroup Thank you. Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From ishikawa ＠ is.s.u-tokyo.ac.jp Thu Mar 8 09:36:47 2007 From: ishikawa ＠ is.s.u-tokyo.ac.jp (Yutaka Ishikawa) Date: Thu, 08 Mar 2007 09:36:47 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] Re: PCCC =?iso-2022-jp?b?GyRCNFhAPiVvITwlLyU3JWclQyVXGyhCIA==?= =?iso-2022-jp?b?GyRCIV0bKEIgMRskQkZ8JEdKLCQrJGsbKEJQQxskQiUvJWklOSU/GyhC?= =?iso-2022-jp?b?GyRCJE44PT51GyhCIBskQiFdGyhCIDMbJEI3bhsoQjE2GyRCRnwbKEI=?= =?iso-2022-jp?b?GyRCMys6RRsoQg==?= In-Reply-To: <20070209.165124.84363694.ishikawa@is.s.u-tokyo.ac.jp> References: <20070209.165124.84363694.ishikawa@is.s.u-tokyo.ac.jp> Message-ID: <20070308.093647.115905800.ishikawa@is.s.u-tokyo.ac.jp> SCoreユーザの皆様、本メーリングリストをお借りして、2007年3月16日(金)に開催するPCクラスタコンソーシアム主催のクラスタに関するワークショップを再度ご案内させて頂きます。今回、「－ 1日で分かるPCクラスタの現状－」と題して関西にてワークショップを以下の通り開催致します。登録締め切りは、3月12日(月)18:00となっております。午前中は、クラスタの入門として、理化学研究所の青山幸也氏にクラスタ上の並列プログラミングの初歩を講演して頂きます。また、PCクラスタコンソーシアムが配布しているSCore 6.0の紹介を日本ヒューレット・パッカードの原田浩氏に講演して頂きます。また、日本の代表的大規模クラスタとして、筑波大学の朴泰祐先生にPACS-CS、東京工業大学の松岡聡先生にTSUBAMEのご講演をお願いしております。石川 -------------------------------------------------------------------------------- PCクラスタコンソーシアム関西ワークショップ－ 1日で分かるPCクラスタの現状－日時：平成19年3月16日（金） 10:00～16:30 会場：富士通株式会社　関西システムラボラトリ 8FセミナールームB http://jp.fujitsu.com/facilities/kansai/ 参加登録締め切り：平成19年3月12日（月）18:00 主催：PCクラスタコンソーシアム参加費：無料定員：100名 http://www.pccluster.org/event/workshop/2007 プログラム ○ 9:30 - 10:00 受付 ○ 10:00 - 10:15 オープニング石川裕 (東京大学) ○ 10:15 - 11:15 並列処理とMPI通信ライブラリ入門青山幸也 (理化学研究所) 概要: 分散メモリー型並列計算機で並列計算を行う際に使用する通信ライブラリMPIと、プログラムを並列化する際の考慮点について概説します。 ○ 11:15 - 11:45 SCore 入門原田浩 (日本ヒューレット・パッカード株式会社) 概要: SCoreとBeowulfクラスタ、どこがちがうのか？ SCoreの歴史と特長を紹介します。 ○ 11:45 - 13:30 break ○ 13:00 - 13:45 PACS-CS と計算科学朴泰祐 (筑波大学) 概要: 筑波大学計算科学研究センターにおいて平成１８年７月から稼動開始した科学技術計算向け超並列クラスタPACS-CSの運用状況を報告する．PACS-CSの性能概略と，現在プロダクトランを継続しているQCDアプリケーションを始め，物性物理・気象シミュレーション等，本センターにおけるアプリケーション事例について紹介する． ○ 13:45 - 14:30 TSUBAME との一年 --- PCクラスタの勝利 --- 松岡聡 (東京工業大学) 概要: TSUBAMEは、我国最高速のスパコンとして設計・実装されたが、一万 CPU規模の「みんなのスパコン」でもあって、莫大なPCのEcosystemを利用することこそが今後の大規模スパコン構築の正しい道筋であることを実証した。そのような TSUBAMEの過去一年の構築から運用経験を語る。 ○ 14:30 - 14:40 break ○ 14:40 - 16:30　パネル討論「クラスタの現状と今後」司会：石川裕 (東京大学) パネリスト：原田浩 (日本ヒューレット・パッカード株式会社) 西克也 (株式会社ベストシステムズ) 竹内義晴 (日本電気株式会社グリッド推進センター) 久門耕一 (株式会社富士通研究所) (TBA) 概要：企業のクラスタに関する現状の取り組みをパネル形式で紹介し、ユーザの要望を聞きながら、今後の取り組みについて議論していきたい。 From kameyama ＠ pccluster.org Thu Mar 8 10:39:17 2007 From: kameyama ＠ pccluster.org (Kameyama Toyohisa) Date: Thu, 08 Mar 2007 10:39:17 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: AW: [SCore-users] Re: SCore 6.0.2.1 is released In-Reply-To: <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA159B6@derum200.emea.corp.eds.com> References: <20070303030003.D1069D02F3@www.pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA1519D@derum200.emea.corp.eds.com> <45ECBE5A.2040205@pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA159B6@derum200.emea.corp.eds.com> Message-ID: <45EF6945.1070204@pccluster.org> Ochtrup, Carsten wrote: > comp207:/lib/modules/2.6.11.4-20a-smp-e1000/extra/score+pm # ls -l * > -rwxr--r-- 1 root root 131209 Mar 4 11:54 allocator_ex_dev.ko > -rwxr--r-- 1 root root 1554098 Mar 4 11:54 e1000_scorepm1.ko > -rwxr--r-- 1 root root 461385 Mar 4 11:54 e100_scorepm1.ko > -rwxr--r-- 1 root root 808261 Mar 4 11:54 infini_dev.ko > -rwxr--r-- 1 root root 321584 Mar 4 11:54 infini_sm_dev.ko > -rwxr--r-- 1 root root 582391 Mar 4 11:54 pm_ethernet_dev_nkp.ko > -rwxr--r-- 1 root root 214960 Mar 4 11:54 pm_ethernet_loader.ko > -rwxr--r-- 1 root root 182568 Mar 4 11:54 pm_memory.ko > -rwxr--r-- 1 root root 247790 Mar 4 11:54 pm_myrinet.ko > -rwxr--r-- 1 root root 189841 Mar 4 11:54 pm_shmem.ko > -rwxr--r-- 1 root root 824377 Mar 4 11:54 tg3_scorepm1.ko ... > netdev -a > > eth0 e1000 > eth1 e1000 > eth2 e1000 > eth3 e1000 If you want to use PM/Ethernet, you must use e1000_scorepm1 driver instead of e1000. Please add the following line in /etc/modprobe.conf.local: alias eth0 e1000_scorepm1 But I don't known module adding on the SUSE 9... Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From kameyama ＠ pccluster.org Thu Mar 8 18:33:16 2007 From: kameyama ＠ pccluster.org (Kameyama Toyohisa) Date: Thu, 08 Mar 2007 18:33:16 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: AW: [SCore-users] Re: SCore 6.0.2.1 is released In-Reply-To: <45EF6945.1070204@pccluster.org> References: <20070303030003.D1069D02F3@www.pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA1519D@derum200.emea.corp.eds.com> <45ECBE5A.2040205@pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA159B6@derum200.emea.corp.eds.com> <45EF6945.1070204@pccluster.org> Message-ID: <45EFD85C.5090101@pccluster.org> Kameyama Toyohisa wrote: > If you want to use PM/Ethernet, you must use e1000_scorepm1 driver > instead of e1000. > > Please add the following line in /etc/modprobe.conf.local: > alias eth0 e1000_scorepm1 > > But I don't known module adding on the SUSE 9... Sorry, SUSE dose not use /etc/modprobe.conf to load network driver. Please use YaST to change network device from e1000 to e1000_scorepm1. Please read 22.4.1 Configuring the Network Card with YaST in SUSE LINUX 9.3 Administration Guide: http://www.novell.com/documentation/suse93/index.html Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From gull ＠ mountain.ocn.ne.jp Thu Mar 8 19:22:29 2007 From: gull ＠ mountain.ocn.ne.jp (=?UTF-8?Q?=E3=81=8B=E3=82=82?= =?UTF-8?Q?=E3=82=81?=) Date: Thu, 08 Mar 2007 19:22:29 +0900 Subject: [SCore-users-jp] =?utf-8?b?44Gv44GY44KB44G+44GX44Gm?= Message-ID: <1173349349.4502.10.camel@localhost.localdomain> 「かもめ」という者です。まったくの素人ですが、よろしくお願いします。 1台のPCのみで、管理ノードと計算ノードを兼用してシステムを構築します。各種設定ファイルの変更についてのアドバイスをお願いします。設定ファイルの内容や、各コマンドの実行結果など必要でしたら、メールにてお送りします。現在地 /opt/score/score6-src cat > adm/config/site JAVA_HOME = /usr/java/jdk1.6.0 JAVA = $(JAVA_HOME)/bin/java ./configure --option=site make cd /opt/score/install ./setup -score_server ./setup -omni cd /opt/score/score6-src/sccfg/release make rpm cd /usr/src/redhat/RPMS/i386 rpm -i sccfg-server-0.0.1-1.i386.rpm rpm -i sccfg-client-0.0.1-1.i386.rpm reboot ... 以上です。 From gull ＠ mountain.ocn.ne.jp Thu Mar 8 19:07:53 2007 From: gull ＠ mountain.ocn.ne.jp (=?iso-2022-jp?b?Z3VsbCAbJEIhdxsoQiBtb3VudGFpbi5vY24ubmUuanA=?=) Date: Thu, 8 Mar 2007 19:07:53 +0900 Subject: [SCore-users-jp] =?utf-8?b?44Gv44GY44KB44G+44GX44Gm?= Message-ID: <200703081907.53869.gull@mountain.ocn.ne.jp> 『かもめ』という者です。まったくの素人ですが、よろしくお願いします。 1台のPCで、管理ノードと計算ノードを兼用させてシステムを構築します。各種設定ファイルの変更についてのアドバイスをお願いします。各コマンドの実行結果をログに保存してます。必要でしたら、メールにてお送りします。現在地 pwd /opt/score/score6-src cat > adm/config/site JAVA_HOME = /usr/java/jdk1.6.0 JAVA = $(JAVA_HOME)/bin/java ./configure --option=site make cd /opt/score/install ./setup -score_server ./setup -omni cd /opt/score/score6-src/sccfg/release make rpm cd /usr/src/redhat/RPMS/i386 rpm -i sccfg-server-0.0.1-1.i386.rpm rpm -i sccfg-client-0.0.1-1.i386.rpm reboot ... 以上です。 From kameyama ＠ pccluster.org Thu Mar 8 20:23:17 2007 From: kameyama ＠ pccluster.org (Kameyama Toyohisa) Date: Thu, 08 Mar 2007 20:23:17 +0900 Subject: [SCore-users-jp] =?ISO-2022-JP?B?GyRCJE8kOCRhJF4kNyRGGyhC?= In-Reply-To: <1173349349.4502.10.camel@localhost.localdomain> References: <1173349349.4502.10.camel@localhost.localdomain> Message-ID: <45EFF225.2020300@pccluster.org> 亀山です. かもめ wrote: > 1台のPCのみで、管理ノードと計算ノードを兼用してシステムを構築します。動かないことは無いですけど, Cluster system software というのは 2 台以上の計算機があったときに意味をもつものなんですが... (まあ, CPU が 2 つ以上あれば遊べるかも知れませんが...) > 各種設定ファイルの変更についてのアドバイスをお願いします。 linux の distribution などが書かれていませんが, CentOS 以外でしょうか? とりあえず, 1 台で動かす設定を簡単に書いてみます. > ./setup -score_server > ./setup -omni ./setup -score_comp も実行してください. ここで必要な module が install されますので, reboot してください. 立ち上がったら /sbin/lsmod などで必要な module ができているのを確認してください. 1 台の場合に必要なのは, pm_memory, pm_shmem, crt, crt_symbol です. 次に必要になるのは /opt/score/etc/scorehosts.db ですが, /opt/score/etc/scorehosts.skel をコピーして, 1 host しか必要が無いので, host1.pccluster.org の行以下を削除します. ここでは macro を使って書いてありますが, 必要なのは, hostname (自分の hostname に変更), msgbserv (自分の hostname になっているはず), cpugen (適当で良い), speed (適当で良い), smp (CPU の数を指定), network (shmem0, shmem1 などを CPU の数だけ), group (必要なだけ) です. foo.example.com msgbserv=foo.example.com cpugen=pentiumIII speed=500 smp=2 network=shmem0,shmem1　group=pcc のようになると思います. PM も shmem しか使用しないので, 他の設定ファイルは不要です. これができたら, scoreboard と msgbserv を立ち上げます. この 2 つの daemon が上がれば scout, scrun などが使用できると思います. Kameyama Toyohisa From carsten.ochtrup ＠ EDS.COM Fri Mar 9 02:56:35 2007 From: carsten.ochtrup ＠ EDS.COM (Ochtrup, Carsten) Date: Thu, 8 Mar 2007 18:56:35 +0100 Subject: [SCore-users-jp] AW: AW: [SCore-users] Re: SCore 6.0.2.1 is released In-Reply-To: <45EFD85C.5090101@pccluster.org> References: <20070303030003.D1069D02F3@www.pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA1519D@derum200.emea.corp.eds.com> <45ECBE5A.2040205@pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA159B6@derum200.emea.corp.eds.com> <45EF6945.1070204@pccluster.org> <45EFD85C.5090101@pccluster.org> Message-ID: <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20ABC8B48@derum200.emea.corp.eds.com> Hallo, the device is created, but with another name. It is /dev/pmether0 instead of /dev/etherpm/0 Creating the etherpm directory and linking the device 0 starts up pm_ethernet. I remember that I had the same problem with SCore 5, as long as I only loaded the module with modprobe. As soon as I used /opt/score/install/mkpmethernetdev to create the devices first, the problem was gone (and the work-around with the link also works, but looks ugly). Mit freundlichen Gruessen / Best regards Carsten Ochtrup _________________ Engineering Systems Development & Support EDS Operation Services GmbH c/o Rolls Royce Ltd. & Co. KG Eschenweg 11 15827 Blankenfelde-Mahlow Tel.: +49-33708-6-1684 Fax: +49-33708-6-511684 mailto:carsten.ochtrup ＠ eds.com -----Ursprüngliche Nachricht----- Von: Kameyama Toyohisa [mailto:kameyama ＠ pccluster.org] Gesendet: Donnerstag, 8. März 2007 10:33 An: Ochtrup, Carsten Cc: score-users ＠ pccluster.org Betreff: Re: AW: [SCore-users] Re: SCore 6.0.2.1 is released Kameyama Toyohisa wrote: > If you want to use PM/Ethernet, you must use e1000_scorepm1 driver > instead of e1000. > > Please add the following line in /etc/modprobe.conf.local: > alias eth0 e1000_scorepm1 > > But I don't known module adding on the SUSE 9... Sorry, SUSE dose not use /etc/modprobe.conf to load network driver. Please use YaST to change network device from e1000 to e1000_scorepm1. Please read 22.4.1 Configuring the Network Card with YaST in SUSE LINUX 9.3 Administration Guide: http://www.novell.com/documentation/suse93/index.html Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From kameyama ＠ pccluster.org Fri Mar 9 09:51:45 2007 From: kameyama ＠ pccluster.org (Kameyama Toyohisa) Date: Fri, 09 Mar 2007 09:51:45 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: AW: AW: [SCore-users] Re: SCore 6.0.2.1 is released In-Reply-To: <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20ABC8B48@derum200.emea.corp.eds.com> References: <20070303030003.D1069D02F3@www.pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA1519D@derum200.emea.corp.eds.com> <45ECBE5A.2040205@pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20AA159B6@derum200.emea.corp.eds.com> <45EF6945.1070204@pccluster.org> <45EFD85C.5090101@pccluster.org> <919A6226844E2B4D821ADCE527A6F20ABC8B48@derum200.emea.corp.eds.com> Message-ID: <45F0AFA1.1070902@pccluster.org> Ochtrup, Carsten wrote: > the device is created, but with another name. > > It is /dev/pmether0 instead of /dev/etherpm/0 > > Creating the etherpm directory and linking the device 0 starts up pm_ethernet. On linux kernel 2.6, /dev directory is managed with udev. When the device driver create device file under /sys file system, udevd create /dev file system using /etc/udev/rules.d/*. On SCore 6, /opt/score/install/linux2.6/mkdevfile (called by setup -score_comp) create udev rules file under /dev/udev/rules.d/60-*.rule. Please check /etc/udev/rules.d/60-pm_ethernet.rules. Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users