[SCore-users-jp] omni openmpの動作環境について

iwa @ strad.ssg.fujitsu.com iwa @ strad.ssg.fujitsu.com
2004年 5月 11日 (火) 19:10:34 JST


いつもお世話になっております。
岩谷@富士通です。

現在、SCore5.4.0にてOmni OpenMPの追加インストールの依頼があり
以下の追加の導入作業テストを実施しております。

1./usr/javaにてtar -jvh j2sdk-1.3.1-FCS-linux-i386.tar.bz2
2./opt/score/score-src/adm/config/siteを作成
     JAVA_HOME = /usr/java/j2sdk1.3.1
       JAVA = $(JAVA_HOME)/bin/java
3.tar xzf /mnt/cdrom/score.source/score-5.4.0.omni.tar.gz
4./opt/score/score.sourceでconfigure
5./opt/score/score.source/runtime/omni配下でsmakeとsmake install

上記作業後にSCASH Omni/OpenMP − はじめにの項に載っているlaplaceを用いた
動作テストをしようとしているのですが

# omcc -omniconfig=scash -o laplace_omp laplace_omp.c
を実施したところ
omcc -omniconfig=scash -o laplace_omp laplace_omp.c
Warning: -ms16m not understood. Ignoring.
Warning: -mx1024m not understood. Ignoring.
Warning: -o not understood. Ignoring.
Exception in thread "main" java.lang.InternalError: unexpected exception during
linking: java.lang.ClassNotFoundException: exc.object.XobjectFile
   at 0x4028115f: java.lang.Throwable.Throwable(java.lang.String) (/usr/lib/libg
cj.so.3)
   at 0x4027408e: java.lang.Error.Error(java.lang.String) (/usr/lib/libgcj.so.3)
   at 0x40281542: java.lang.VirtualMachineError.VirtualMachineError(java.lang.St
ring) (/usr/lib/libgcj.so.3)
   at 0x40275a92: java.lang.InternalError.InternalError(java.lang.String) (/usr/
lib/libgcj.so.3)
   at 0x40273146: java.lang.ClassLoader.resolveClass0(java.lang.Class) (/usr/lib
/libgcj.so.3)
   at 0x4024190b: _Jv_PrepareClass(java.lang.Class) (/usr/lib/libgcj.so.3)
   at 0x40260568: java.lang.ClassLoader.linkClass0(java.lang.Class) (/usr/lib/li
bgcj.so.3)
   at 0x40273073: java.lang.ClassLoader.resolveClass0(java.lang.Class) (/usr/lib
/libgcj.so.3)
   at 0x4025e99c: java.lang.Class.initializeClass() (/usr/lib/libgcj.so.3)
   at 0x4025d224: java.lang.Class.forName(java.lang.String, boolean, java.lang.C
lassLoader) (/usr/lib/libgcj.so.3)
   at 0x4025d2bf: java.lang.Class.forName(java.lang.String) (/usr/lib/libgcj.so.
3)
   at 0x402c60a0: gnu.gcj.runtime.FirstThread.run() (/usr/lib/libgcj.so.3)
   at 0x40267fdc: _Jv_ThreadRun(java.lang.Thread) (/usr/lib/libgcj.so.3)
   at 0x4023478c: _Jv_RunMain(java.lang.Class, byte const, int, byte const, bool
ean) (/usr/lib/libgcj.so.3)
   at 0x08048900: __gcj_personality_v0 (OMPC_DIR=/opt/score/omni/lib/openmp/gcc)
   at 0x420158d4: __libc_start_main (OMPC_DIR=/opt/score/omni/lib/openmp/gcc)
   at 0x080486c1: _Jv_RegisterClasses (OMPC_DIR=/opt/score/omni/lib/openmp/gcc)
というjavaクラスに関すると思われるメッセージが出て、実行モジュールが作成されません。

そこで
教えて欲しいのですが、SCore5.4.0のCDに入っているomni openmpと整合性の合うJDKは、
j2sdk-1.3.1-FCS-linuxで問題ないのでしょうか?
また、上記エラーの原因、対処方法が判れば教えて下さい。

[実行環境]
マシン:当社PRIMERGY TS220 ・・・社内テスト環境
管理Node+計算Node×5

OS:RHL8.0(2.4.18-14smp)
SCore5.4.0(Kernel 2.4.19)

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富士通株式会社  HPCシステム部)
岩谷正樹/Masaki Iwatani
TEL:043-299-3252 (内)7055-2889
FAX:043-299-3644 (内)7055-5583
E-mail to:iwamasa @ jp.fujitsu.com
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