From kinleong8 ＠ netvigator.com Tue Jun 1 20:03:06 2004 From: kinleong8 ＠ netvigator.com (=?iso-2022-jp?b?a2lubGVvbmc4IBskQiF3GyhCIG5ldHZpZ2F0b3IuY29t?=) Date: Tue, 1 Jun 2004 19:03:06 +0800 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] A SCore problem Message-ID: <20040601110306.OWSA13482.imsm042dat.netvigator.com@imailmta.netvigator.com> I have a problem on runnig the SCore enviroment. During I use this command "scout -g cluster", it does not succeed and gives the following message: SCOUT: Spawning node2.cluster node4.cluster : No router to host [node1.cluster]: Spawn timed out SCOUT: Session done It cannot run the Scout enviroment sucessfully. I have 5 nodes, node1 to node5 and the NIS is "cluster". Best regards, Eric Chan _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From kameyama ＠ pccluster.org Tue Jun 1 20:09:51 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Tue, 01 Jun 2004 20:09:51 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: [SCore-users] A SCore problem In-Reply-To: Your message of "Tue, 01 Jun 2004 19:03:06 JST." <20040601110306.OWSA13482.imsm042dat.netvigator.com@imailmta.netvigator.com> Message-ID: <20040601110234.91EB412894C@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> In article <20040601110306.OWSA13482.imsm042dat.netvigator.com ＠ imailmta.netvigator.com> wrotes: > I have a problem on runnig the SCore enviroment. During I use this command "s > cout -g cluster", it does not succeed and gives the following message: > SCOUT: Spawning node2.cluster node4.cluster : No router to host > [node1.cluster]: Spawn timed out > SCOUT: Session done 1. All nodes of cluster are alive? Please execute following command: % sceptic -v -g cluster 2. all nodes can rsh from the host? Please execute following command: % rsh-all -g cluster date from Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From ricil ＠ yahoo.com Wed Jun 2 16:28:29 2004 From: ricil ＠ yahoo.com (Anita Taylor) Date: 02 Jun 2004 04:28:29 -0300 Subject: [SCore-users-jp] Goood health shipped at your doorstep Message-ID: <20040602042829.kc8PZkvblonb@yahoo.com> Cialis & V-agra at h ＠ lf price
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contrast teledyne discriminatory translate durrell chambermaid thrifty guideline precede elusive analogous ponder countryman From yoshihiro551230 ＠ bc.wakwak.com Fri Jun 4 10:46:03 2004 From: yoshihiro551230 ＠ bc.wakwak.com (Yoshihiro ISHIKAWA) Date: Fri, 4 Jun 2004 10:46:03 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Resource low Message-ID: <005e01c449d5$b1f2fd50$6f501da0@airfoceone> メーリングリストの皆様 岩手大学の石川と申します．いつもお世話になっております． マルチユーザモードでSCore5.6.1を使用しているのですが， 資源に空きがあるにも関わらず，Resource lowというメッセージ が出て，ジョブの投入を受け付けなくなりました． 原因に関して何かお分かりになる方がいらっしゃいましたら ご教授頂けないでしょうか？ ==================================== 岩手大学大学院工学研究科機械工学専攻 航空宇宙システム部門/船崎・山田研究室 修士課程２年　石川慶拓 Yoshihiro Ishikawa mail yoshihiro551230 ＠ bc.wakwak.com ==================================== From delivery ＠ hosyou-b.mine.nu Sat Jun 5 19:49:49 2004 From: delivery ＠ hosyou-b.mine.nu (株式会社経済文庫) Date: Sat, 5 Jun 2004 19:49:49 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] ■６千万円迄で、年収不足の 方に歓迎■２千万円１億円４億 円証拠有収入の方法■何故に儲 かるを知る方法■005２6号 Message-ID: <3382701.1086432589023.JavaMail.nobody@hosyou-b.mine.nu> score-users-jp ＠ pccluster.org様 　 　　　　　　　　　　　　　　　　　　 [時代のめーるマガジン]００５２７号 　　　　　　　　　 ━[PR]━１億円・２億円以上収入者続出━━ネットで出来る個人ビジネス━━ 　　　　　　　　　　　　　　　●収入の証拠見せます。　在宅ネットで出来ます。　簡単ビジネスで出来ます。 　　　　　　　　　　 創業４８年の実績有ります。経営者、主婦、自由業、公務員、銀行員、自営業 　　　　　　　　　　 ２０歳以上の男女、各種代理店、北海道から沖縄の全国的、参加しています。 　　　　　　　　　　 収入は各自の銀行に振り込みます。 　　 但し１千万円以下の収入目的の方はご遠慮願います。 　　　　　　　　　　　 　　 詳しくは　　　　 http://hosyou003.orgdns.org 　　　　　　　　　　　 　　北海道 から 沖縄 の 全国的に 提供しているのは 　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　 【５億９千万円証拠有ビジネス】と【保証証券ー保証の責任は有りません】 　　　　　　　　　　 　 　　　　　　　　　　　　　 　　 http://hosyou003.orgdns.org/page1.htm　からもチャンスを！！ 　 http://hosyou003.orgdns.org/qanda11.html　からＱ＆Ａで簡単に 　　　　　　　　　　　　　　　━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 　　　　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 ◆世の中は、シンプルです・複雑に考えると迷います◆ 　　 　　　　　　　　　　　　　　　◆お金が沢山ある人は頭をさげずに、欲しい物が自由に手に入ります。 　　 　　　　　　　　　　　　　　　◇ところが、お金がない、足りない、人はプライドを捨てて他人に、イヤナ人 　　　　　　　　　　　　　　　　に頭をさげなければなりません。 　　　 　　　　　　　　　　　　　　　詳しくは、頭をさげてプライドを捨てたくない人は、このメールマガジンから 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インストールしようとしたのですがこの機種にはＬＡＮポートがないので coregaのFEther PCC-TXDというＰＣカードを使おうとしたのですが eitで作成したブートフロッピーではこのデバイスが認識されないため インストールをすることができません。 どうやったらよいのでしょうか？よろしくお願いします ------ 武蔵工業大学工学部情報処理センター研究室 青木　節夫（あおき　せつお） From g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp Sat Jun 5 22:02:28 2004 From: g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp (AOKI Setsuo) Date: Sat, 05 Jun 2004 22:02:28 +0900 Subject: [SCore-users-jp] 計算ホストにインストールができません Message-ID: <40C1C464.5090509@sc.musashi-tech.ac.jp> 青木と申します。 　Score5.6.1の計算クラスタとしてTOSHIBA　Satellite Pro 460CDTに インストールしようとしたのですがこの機種にはＬＡＮポートがないので coregaのFEther PCC-TXDというＰＣカードを使おうとしたのですが eitで作成したブートフロッピーではこのデバイスが認識されないため インストールを続行することができません。 どうやったらよいのでしょうか？よろしくお願いします --- 武蔵工業大学 工学部 青木　節夫(あおき せつお) E-mail: g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp From domenico ＠ zen.co.uk Sun Jun 6 14:14:34 2004 From: domenico ＠ zen.co.uk (=?Windows-1251?B?wuDr5fDo6SDL4O344Oru4g==?=) Date: Sun, 06 Jun 2004 05:14:34 +0000 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] Re: Message-ID: <200406060523.i565NfX07795@pccluster.org> Предлагаем Базы Данных фирм и e-mail адресов для организации электронной коммерции на предприятии и ведения бизнеса в сети. подробности на сайте http://rutas.port5.com/ _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From raghu ＠ ecsa.com Mon Jun 7 05:49:59 2004 From: raghu ＠ ecsa.com (=?Windows-1251?B?wuDr5fDo6SDL4O344Oru4g==?=) Date: Sun, 06 Jun 2004 20:49:59 +0000 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] Re: Message-ID: <200406062053.i56KrpX11902@pccluster.org> Предлагаем Базы Данных фирм и e-mail адресов для организации электронной коммерции на предприятии и ведения бизнеса в сети. подробности на сайте http://rutas.p6.org.uk/ _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From kameyama ＠ pccluster.org Mon Jun 7 16:57:54 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Mon, 07 Jun 2004 16:57:54 +0900 Subject: [SCore-users-jp] PCMCIA接続のＬＡＮカードが認識されない In-Reply-To: Your message of "Sat, 05 Jun 2004 21:54:13 JST." <20040605125358.32F0D1EB35F@ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> Message-ID: <20040607075018.7D819128950@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> 亀山です. In article <20040605125358.32F0D1EB35F ＠ ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> "Setsuo AOKI" wrotes: > 　Score5.6.1の計算クラスタとしてTOSHIBA　Satellite Pro 460CDTに > インストールしようとしたのですがこの機種にはＬＡＮポートがないので > coregaのFEther PCC-TXDというＰＣカードを使おうとしたのですが > eitで作成したブートフロッピーではこのデバイスが認識されないため > インストールをすることができません。 SCore 付属の floppy は PCMCIA には対応していません. PCMCIA および FEther PCC-TXD で install させるためには floppy image kをかなりいじる必用がありそうです. 多分, EIT を使用しないで install するしかないと思います. (install できても, 動くかどうか, 性能がデルかどうかは不明ですけど... from Kameyama Toyohisa From g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp Mon Jun 7 18:19:35 2004 From: g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp (Setsuo AOKI) Date: Mon, 7 Jun 2004 18:19:35 +0900 Subject: [SCore-users-jp] PCMCIA接続のＬＡＮカードが認識されない In-Reply-To: <20040607075018.7D819128950@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> Message-ID: <20040607091918.23BF71EB35F@ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> 青木です。 　亀山様返信ありがとうございます。 とりあえずＥＩＴなしでinstallしたいと思います。 ------ 武蔵工業大学工学部電子情報工学科 青木　節夫（あおき　せつお） From g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp Mon Jun 7 22:38:53 2004 From: g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp (Setsuo AOKI) Date: Mon, 7 Jun 2004 22:38:53 +0900 Subject: [SCore-users-jp] ＥＩＴ時のエラー In-Reply-To: <20040607091918.23BF71EB35F@ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> Message-ID: <20040607133835.72CD71EB35F@ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> 青木です。 　ＥＩＴを使って計算ホストのインストールは終わりサーバの設定に進むと 下記のようなエラーが出て進まなくなってしまいます。 Cannot create /opt/score/etc/pm-ethernet.conf "/opt/score/etc/ndconf/pmethernetconf-skelton:1:13: 0: そのようなファイルや ディレクトリはありません" 調べたのですが /opt/score/etc/pm-ethernet.conf は存在しますし /opt/score/etc/ndconf/pmethernetconf-skelton というファイルもありました。 どうしたら設定を続行できるのでしょうか？ ------ 武蔵工業大学工学部電子情報工学科 青木　節夫（あおき　せつお） From kameyama ＠ pccluster.org Tue Jun 8 09:13:34 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Tue, 08 Jun 2004 09:13:34 +0900 Subject: [SCore-users-jp] ＥＩＴ時のエラー In-Reply-To: Your message of "Mon, 07 Jun 2004 22:38:53 JST." <20040607133835.72CD71EB35F@ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> Message-ID: <20040608000556.85014128950@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> 亀山です. In article <20040607133835.72CD71EB35F ＠ ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> "Setsuo AOKI" wrotes: > 　ＥＩＴを使って計算ホストのインストールは終わりサーバの設定に進むと > 下記のようなエラーが出て進まなくなってしまいます。 > > Cannot create /opt/score/etc/pm-ethernet.conf > "/opt/score/etc/ndconf/pmethernetconf-skelton:1:13: 0: そのようなファイルや > ディレクトリはありません" これは, pm-ethernet.conf を作成するのに /opt/score/etc/ndconf/0 というファイルを include しているのですが, このファイルが存在しないため このエラーが出ています. このしたの数字のファイルは compute host を install したときに作成するものです. 過去の mail から, 判断すると, node 0 は server を compute host と兼用 させようとしているのだと思います. http://www.pccluster.org/pipermail/score-users-jp/2004-March/002103.html http://www.pccluster.org/pipermail/score-users-jp/2004-April/002208.html server で, このファイルを作成するときは /opt/score/setup/install/hostinfo server_host_name /opt/score/etc/ndconf を実行しているのですが, ここでエラーが出ているのだと思います. server_host_name は EIT が認識した hostname で eth0 の IP address を逆引きして得たものです. hostinfo は自分のホスト名を /etc/sysconfig/network の HOSTNAME の行からとってきています. 多分, ここが server_host_name と一致していないものと推測します. > どうしたら設定を続行できるのでしょうか？ /etc/sysconfig/network の HOSTNAME に代入されている名前を server_host_name と同じ ものにして /opt/score/setup/install/hostinfo server_host_name /opt/score/etc/ndconf を実行してから Next を押してみてください. from Kameyama Toyohisa From g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp Tue Jun 8 09:54:41 2004 From: g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp (Setsuo AOKI) Date: Tue, 8 Jun 2004 09:54:41 +0900 Subject: [SCore-users-jp] RE: ＥＩＴ時のエラー Message-ID: <20040608005422.55CDF1EB35F@ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> 青木です。 　表記の件解決いたしました。ご迷惑をおかけしました ------ 武蔵工業大学工学部電子情報工学科 青木　節夫（あおき　せつお） -----Original Message----- From: Setsuo AOKI [mailto:g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp] Sent: Monday, June 07, 2004 10:39 PM To: 'score-users-jp ＠ pccluster.org' Subject: ＥＩＴ時のエラー 青木です。 　ＥＩＴを使って計算ホストのインストールは終わりサーバの設定に進むと 下記のようなエラーが出て進まなくなってしまいます。 Cannot create /opt/score/etc/pm-ethernet.conf "/opt/score/etc/ndconf/pmethernetconf-skelton:1:13: 0: そのようなファイルや ディレクトリはありません" 調べたのですが /opt/score/etc/pm-ethernet.conf は存在しますし /opt/score/etc/ndconf/pmethernetconf-skelton というファイルもありました。 どうしたら設定を続行できるのでしょうか？ ------ 武蔵工業大学工学部電子情報工学科 青木　節夫（あおき　せつお） From k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Thu Jun 10 09:31:15 2004 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com (=?iso-2022-jp?b?ay1pa2VnYW1pIBskQiF3GyhCIGFqLmpwLm5lYy5jb20=?=) Date: Thu, 10 Jun 2004 09:31:15 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re:Re:Re: [SCore-users-jp]PMのエラー等について In-Reply-To: <20040426140203k-ikegami@mail.jp.nec.com> References: <20040426140203k-ikegami@mail.jp.nec.com> Message-ID: <20040610093115k-ikegami@mail.jp.nec.com> 住元様 １ヶ月以上前（4/23）に、PM/EthernetにてCheckSumエラーが 発生する件について、ご相談させて頂いた池上です。 異なるスイッチで試してみては？というご助言を頂きましたが、マシンを 自由に触れる環境に無く、今まで時間を要してしまいました。 さて、結果ですが、100Base-Tの全く異なるスイッチを使用して見たところ、 やはりCheck sum errorが発生してしまいました。 頻度としては、１５時間の連続運転で１３件でした。（全てHeader Checksum error） この状況から、ＮＩＣ周りに原因がありそうですが、PMコンフィギュレーションファイル設定の チューニングで回避できるような問題なのか、それとも純粋にＨＷに依存する問題なのか？ 見解を頂ければ幸いです。 2004/04/26 14:02:03 +0900にk-ikegami ＠ aj.jp.nec.comさんに頂いた 「[SCore-users-jp] Re: [SCore-users-jp]PMのエラー等について」への返事です。 >住元様 > >池上です。 > >>k-ikegami> >この2つのクラスタは同じスイッチにつながっているのでしょうか? もし、同 >>k-ikegami> >じスイッチにつながっているのであれば、スイッチが怪しいのかも知れません。 >>k-ikegami> > >>k-ikegami> >以前、スイッチに内蔵されているバッファメモリのビット化けにより同様の現 >>k-ikegami> >象に遭遇したことがあります。 >>k-ikegami> >>k-ikegami> 二つのクラスタは完全に分離されており、スイッチも物理的に別のものです。 >>k-ikegami> プロセッサ、スイッチともに型番は全く同じものです。 >>k-ikegami> >>k-ikegami> 同じスイッチ（ＳＭＣ８６２４Ｔ）を使用しておられる方いらっしゃいませんか？ >>k-ikegami> 安心したいのですが。。 >> >>2台ともそうなのであれば、スイッチ個体の問題ではないですね、 >> >>スイッチの問題かどうかを切り分けるために、100BTで結構ですので別のスイッ >>チに接続してどうなるかを見て頂けないでしょうか? > >マシンを常時触れる環境に無いので、直ぐには試せないのですが、 >実施次第、報告させて頂きます。 >（質問しておいて申し訳ありません。） > >/*----------------------------------------------*/ >// 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com >_______________________________________________ >SCore-users-jp mailing list >SCore-users-jp ＠ pccluster.org >http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users-jp /*----------------------------------------------*/ // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 From s-sumi ＠ flab.fujitsu.co.jp Thu Jun 10 09:56:59 2004 From: s-sumi ＠ flab.fujitsu.co.jp (Shinji Sumimoto) Date: Thu, 10 Jun 2004 09:56:59 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] Re:Re:Re: [SCore-users-jp]PM のエラー等について In-Reply-To: <20040610093115k-ikegami@mail.jp.nec.com> References: <20040426140203k-ikegami@mail.jp.nec.com> <20040610093115k-ikegami@mail.jp.nec.com> Message-ID: <20040610.095659.730563996.s-sumi@flab.fujitsu.co.jp> 池上様 富士通研の住元です。 こちらでも試してみましたが、Xeon + e1000の組合せでは長時間走らせている とHeader Checksum errorが頻度はかなり低いですが、出ることを確認しまし た。個別のノードに偏っていない場合でData Checksum errorが出ていなけれ ばネットワーク的には問題ないです。 以前、同様の現象は、eepro100でも観測していて、送信のPCI DMA時にDMAが失 敗する場合があり、それがHeader Checksum Errorを引き起こす場合があるこ とがありました。 以上、よろしくお願いします。 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Subject: [SCore-users-jp] Re:Re:Re: [SCore-users-jp]PM のエラー等について Date: Thu, 10 Jun 2004 09:31:15 +0900 Message-ID: <20040610093115k-ikegami ＠ mail.jp.nec.com> k-ikegami> 住元様 k-ikegami> k-ikegami> １ヶ月以上前（4/23）に、PM/EthernetにてCheckSumエラーが k-ikegami> 発生する件について、ご相談させて頂いた池上です。 k-ikegami> 異なるスイッチで試してみては？というご助言を頂きましたが、マシンを k-ikegami> 自由に触れる環境に無く、今まで時間を要してしまいました。 k-ikegami> k-ikegami> さて、結果ですが、100Base-Tの全く異なるスイッチを使用して見たところ、 k-ikegami> やはりCheck sum errorが発生してしまいました。 k-ikegami> 頻度としては、１５時間の連続運転で１３件でした。（全てHeader Checksum error） k-ikegami> この状況から、ＮＩＣ周りに原因がありそうですが、PMコンフィギュレーションファイル設定の k-ikegami> チューニングで回避できるような問題なのか、それとも純粋にＨＷに依存する問題なのか？ k-ikegami> 見解を頂ければ幸いです。 k-ikegami> k-ikegami> 2004/04/26 14:02:03 +0900にk-ikegami ＠ aj.jp.nec.comさんに頂いた k-ikegami> 「[SCore-users-jp] Re: [SCore-users-jp]PMのエラー等について」への返事です。 k-ikegami> >住元様 k-ikegami> > k-ikegami> >池上です。 k-ikegami> > k-ikegami> >>k-ikegami> >この2つのクラスタは同じスイッチにつながっているのでしょうか? もし、同 k-ikegami> >>k-ikegami> >じスイッチにつながっているのであれば、スイッチが怪しいのかも知れません。 k-ikegami> >>k-ikegami> > k-ikegami> >>k-ikegami> >以前、スイッチに内蔵されているバッファメモリのビット化けにより同様の現 k-ikegami> >>k-ikegami> >象に遭遇したことがあります。 k-ikegami> >>k-ikegami> k-ikegami> >>k-ikegami> 二つのクラスタは完全に分離されており、スイッチも物理的に別のものです。 k-ikegami> >>k-ikegami> プロセッサ、スイッチともに型番は全く同じものです。 k-ikegami> >>k-ikegami> k-ikegami> >>k-ikegami> 同じスイッチ（ＳＭＣ８６２４Ｔ）を使用しておられる方いらっしゃいませんか？ k-ikegami> >>k-ikegami> 安心したいのですが。。 k-ikegami> >> k-ikegami> >>2台ともそうなのであれば、スイッチ個体の問題ではないですね、 k-ikegami> >> k-ikegami> >>スイッチの問題かどうかを切り分けるために、100BTで結構ですので別のスイッ k-ikegami> >>チに接続してどうなるかを見て頂けないでしょうか? k-ikegami> > k-ikegami> >マシンを常時触れる環境に無いので、直ぐには試せないのですが、 k-ikegami> >実施次第、報告させて頂きます。 k-ikegami> >（質問しておいて申し訳ありません。） k-ikegami> > k-ikegami> >/*----------------------------------------------*/ k-ikegami> >// 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com k-ikegami> >_______________________________________________ k-ikegami> >SCore-users-jp mailing list k-ikegami> >SCore-users-jp ＠ pccluster.org k-ikegami> >http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users-jp k-ikegami> /*----------------------------------------------*/ k-ikegami> // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com k-ikegami> // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 k-ikegami> // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 k-ikegami> _______________________________________________ k-ikegami> SCore-users-jp mailing list k-ikegami> SCore-users-jp ＠ pccluster.org k-ikegami> http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users-jp k-ikegami> k-ikegami> ------ Shinji Sumimoto, Fujitsu Labs From k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Thu Jun 10 20:48:00 2004 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com (=?iso-2022-jp?b?ay1pa2VnYW1pIBskQiF3GyhCIGFqLmpwLm5lYy5jb20=?=) Date: Thu, 10 Jun 2004 20:48:00 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re:Re:Re:Re: [SCore-users-jp]PM のエラー等について In-Reply-To: <20040610.095659.730563996.s-sumi@flab.fujitsu.co.jp> References: <20040610.095659.730563996.s-sumi@flab.fujitsu.co.jp> Message-ID: <20040610204800k-ikegami@mail.jp.nec.com> 住元様 池上です。わざわざ試してまで頂き、ありがとうございました。 >個別のノードに偏っていない場合でData Checksum errorが出ていなけれ >ばネットワーク的には問題ないです。 > >以前、同様の現象は、eepro100でも観測していて、送信のPCI DMA時にDMAが失 >敗する場合があり、それがHeader Checksum Errorを引き起こす場合があるこ >とがありました。 そう言っていただくと、少し安心できますが。。 Header Checksum ErrorとData Checksum Errorの意味するところ（原因、影響） には違いがあるという事でしょうか？ どうも、エラー表示が出たままでは落ち着けないもので。。 /*----------------------------------------------*/ // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 From s-sumi ＠ flab.fujitsu.co.jp Thu Jun 10 22:08:31 2004 From: s-sumi ＠ flab.fujitsu.co.jp (Shinji Sumimoto) Date: Thu, 10 Jun 2004 22:08:31 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] Re: [SCore-users-jp]PM のエラー等について In-Reply-To: <20040610204800k-ikegami@mail.jp.nec.com> References: <20040610.095659.730563996.s-sumi@flab.fujitsu.co.jp> <20040610204800k-ikegami@mail.jp.nec.com> Message-ID: <20040610.220831.28794396.s-sumi@flab.fujitsu.co.jp> 富士通研の住元です。 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Subject: Re:Re:Re:Re: [SCore-users-jp]PM のエラー等について Date: Thu, 10 Jun 2004 20:48:00 +0900 Message-ID: <20040610204800k-ikegami ＠ mail.jp.nec.com> k-ikegami> 住元様 k-ikegami> k-ikegami> 池上です。わざわざ試してまで頂き、ありがとうございました。 k-ikegami> k-ikegami> >個別のノードに偏っていない場合でData Checksum errorが出ていなけれ k-ikegami> >ばネットワーク的には問題ないです。 k-ikegami> > k-ikegami> >以前、同様の現象は、eepro100でも観測していて、送信のPCI DMA時にDMAが失 k-ikegami> >敗する場合があり、それがHeader Checksum Errorを引き起こす場合があるこ k-ikegami> >とがありました。 k-ikegami> k-ikegami> k-ikegami> そう言っていただくと、少し安心できますが。。 k-ikegami> Header Checksum ErrorとData Checksum Errorの意味するところ（原因、影響） k-ikegami> には違いがあるという事でしょうか？ k-ikegami> どうも、エラー表示が出たままでは落ち着けないもので。。 errorといっても再送されて問題ないと言うエラーですが、、 Data Checksum Errorが出ていないと言うことはネットワークの通信でのエラー ではなくNICの送信時に発生しているものと考えられるからです。 実際にデータ化けを調べてみましたが、以下のように受信パケットのheaderに 埋め込まれているcksumのデータが固定値となっています。 (head 600000 != calc 955ad8af) header内のcksum data 実際に計算した値 PM/Etherentでは、同じバッファを短時間に頻繁に使い回すので、たまに secondary cacheに乗ったデータを PCI DMAが転送するときにうまく転送でき ず、メモリ上のデータを転送する場合があるようです。以前徹底的に調査した ときには送信時には正しいcksumが書かれていることを確認しています。 ======================================================================== ** PM/Ethernet WARNING: Header Checksum error1: from 600006 (head 600000 != calc 955ad8af) len = 1488 ignored ** PM/Ethernet WARNING: Header Checksum error1: from 600006 (head 600000 != calc a32bd8ae) len = 1488 ignored ** PM/Ethernet WARNING: Header Checksum error1: from 600006 (head 600000 != calc cd73d8ad) len = 1488 ignored ** PM/Ethernet WARNING: Header Checksum error1: from 600006 (head 600000 != calc 4ef2d8ac) len = 1488 ignored ** PM/Ethernet WARNING: Header Checksum error1: from 600006 (head 600000 != calc afe0d8a3) len = 1488 ignored ** PM/Ethernet WARNING: Header Checksum error1: from 600006 (head 600000 != calc 740d8a2) len = 1488 ignored ** PM/Ethernet WARNING: Header Checksum error1: from 600006 (head 600000 != calc 1865d8a1) len = 1488 ignored ** PM/Ethernet WARNING: Header Checksum error1: from 600006 (head 600000 != calc ff1558a0) len = 1488 ignored ======================================================================== つまり、ネットワークではなくサーバ内部でのDMAエラーと想定されます。これは、 PentiumII+eepro100の時代からたまに発生していました。 いづれにしろ、元々信頼性のあるプロトコルを使っているので、cksumエラー が出ても再送して問題は無いはずです。 ------ Shinji Sumimoto, Fujitsu Labs From xiao ＠ online.no Fri Jun 11 03:25:34 2004 From: xiao ＠ online.no (=?Windows-1251?B?wuDr5fDo6SDL4O344Oru4g==?=) Date: Thu, 10 Jun 2004 18:25:34 +0000 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] Re: Message-ID: <200406101834.i5AIYQX04649@pccluster.org> Предлагаем Базы Данных фирм и e-mail адресов для организации электронной коммерции на предприятии и ведения бизнеса в сети. подробности на сайте http://databasez.7p.org.uk/ _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Fri Jun 11 09:40:09 2004 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com (=?iso-2022-jp?b?ay1pa2VnYW1pIBskQiF3GyhCIGFqLmpwLm5lYy5jb20=?=) Date: Fri, 11 Jun 2004 09:40:09 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: [SCore-users-jp]PMのエラー等について In-Reply-To: <20040610.220831.28794396.s-sumi@flab.fujitsu.co.jp> References: <20040610.220831.28794396.s-sumi@flab.fujitsu.co.jp> Message-ID: <20040611094009k-ikegami@mail.jp.nec.com> 住元様 池上です。 なるほど！ > >個別のノードに偏っていない場合でData Checksum errorが出ていなけれ > >ばネットワーク的には問題ないです。 上記コメントの意味が理解できました。 貴重な実験データを見せていただき、大変勉強になりました。 ありがとうございました。 今後ともよろしくおねがいいたします。 /*----------------------------------------------*/ // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 From laurent.duhem ＠ esi-group.com Tue Jun 15 02:35:25 2004 From: laurent.duhem ＠ esi-group.com (laurent duhem) Date: Mon, 14 Jun 2004 19:35:25 +0200 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] scrun and dynamically linked executable Message-ID: <002601c45235$f9cd9280$1c11a8c0@moloss> Hello there, I am having tough time to get simple dynamically linked executable working with Score 5.6.1. It seems not all the environment variables are exported with scrun, especially LD_LIBRARY_PATH !! Is there a way to tell compute nodes where to look for dynamic dependencies ? Thanks in advance. Duhem Laurent ESI Software +33 (0)478141264 laurent.duhem ＠ esi-group.com -------------- next part -------------- HTMLの添付ファイルを保管しました... URL: From kameyama ＠ pccluster.org Tue Jun 15 09:21:22 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Tue, 15 Jun 2004 09:21:22 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: [SCore-users] scrun and dynamically linked executable In-Reply-To: Your message of "Mon, 14 Jun 2004 19:35:25 JST." <002601c45235$f9cd9280$1c11a8c0@moloss> Message-ID: <20040615001321.8CCDD128953@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> In article <002601c45235$f9cd9280$1c11a8c0 ＠ moloss> "laurent duhem" wrotes: > I am having tough time to get simple dynamically linked executable working > with Score 5.6.1. > > It seems not all the environment variables are exported with scrun, > especially LD_LIBRARY_PATH !! scrun and scout has set uid to root. So scrun and scout ignore LD_LIBRARY_PATH and some environment variables for security. > Is there a way to tell compute nodes where to look for dynamic dependencies > ? Please edit /etc/ld.so.conf on the compute hosts. from Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From rajeev ＠ skynet.be Thu Jun 17 11:41:24 2004 From: rajeev ＠ skynet.be (=?Windows-1251?B?wuDr5fDo6SDL4O344Oru4g==?=) Date: Thu, 17 Jun 2004 02:41:24 +0000 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] Re: Message-ID: <200406161947.i5GJlJX20944@pccluster.org> Предлагаем Базы Данных фирм и e-mail адресов для организации электронной коммерции на предприятии и ведения бизнеса в сети. подробности на сайте http://databasez.port5.com/ _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp Thu Jun 17 13:26:24 2004 From: hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp (Hayashi Masaki) Date: Thu, 17 Jun 2004 13:26:24 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Omni OpenMP Compiler Message-ID: <20040617101311.9460.HAYASHI@hpc.cs.ritsumei.ac.jp> メーリングリストの皆様 立命館大学の林と申します。いつもお世話になっております。 現在Redhat Linux 8.0＋SCore5.6.1でPC Clusterを構築しているのですが Omni OpenMPコンパイラだけ正しくインストールできません。 SCoreドキュメントとメーリングリストを参考に 再コンパイルしました。 Omni OpenMPコンパイラをインストールするためJDKをダウンロードし # mkdir /usr/java # cd /usr/java # tar xjf /opt/score.work/j2sdk-1.3.1-FCS-linux-i386.tar.bz2 と /usr/java に展開しました。 そして /opt/score/score-src/adm/config/site ファイルに JAVA_HOME = /usr/java/j2sdk1.3.1 JAVA = $(JAVA_HOME)/bin/java と記入し # cd /opt/score # for tarfile in /opt/score.work/*.tar.gz # do # tar xzf $tarfile # done # cd score-src # ./configure --option=site # make と行い、その他すべての設定をし、通信テストも行いました。 最後にOmni OpenMP コンパイラのテストをしたところ、 Warning: -ms16m not understood. Ignoring. Warning: -mx1024m not understood. Ignoring. Exception in thread "main" java.lang.InternalError: unexpected exception during linking: java.lang.ClassNotFoundException: exc.object.XobjectFile at 0x4028115f: java.lang.Throwable.Throwable(java.lang.String) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x4027408e: java.lang.Error.Error(java.lang.String) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x40281542: java.lang.VirtualMachineError.VirtualMachineError(java.lang.String) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x40275a92: java.lang.InternalError.InternalError(java.lang.String) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x40273146: java.lang.ClassLoader.resolveClass0(java.lang.Class) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x4024190b: _Jv_PrepareClass(java.lang.Class) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x40260568: java.lang.ClassLoader.linkClass0(java.lang.Class) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x40273073: java.lang.ClassLoader.resolveClass0(java.lang.Class) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x4025e99c: java.lang.Class.initializeClass() (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x4025d224: java.lang.Class.forName(java.lang.String, boolean, java.lang.ClassLoader) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x4025d2bf: java.lang.Class.forName(java.lang.String) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x402c60a0: gnu.gcj.runtime.FirstThread.run() (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x40267fdc: _Jv_ThreadRun(java.lang.Thread) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x4023478c: _Jv_RunMain(java.lang.Class, byte const, int, byte const, boolean) (/usr/lib/libgcj.so.3) at 0x08048900: __gcj_personality_v0 (OMPC_DIR=/opt/score/../omni/lib/openmp/gcc) at 0x420158d4: __libc_start_main (OMPC_DIR=/opt/score/../omni/lib/openmp/gcc) at 0x080486c1: _Jv_RegisterClasses (OMPC_DIR=/opt/score/../omni/lib/openmp/gcc) というエラーが出て実行モジュールが作成されませんでした。 その後、メーリングリストを参照したところ 同じエラーで質問されている方がいらっしゃったので > In article <200405111010.AA02961 ＠ f4ej.strad.ssg.fujitsu.com> iwa ＠ strad.ssg.fujitsu.com wrotes: > > １．/usr/javaにてtar -jvh j2sdk-1.3.1-FCS-linux-i386.tar.bz2 > > ２．/opt/score/score-src/adm/config/siteを作成 > > 　　 JAVA_HOME = /usr/java/j2sdk1.3.1 > > JAVA = $(JAVA_HOME)/bin/java > > ３．tar xzf /mnt/cdrom/score.source/score-5.4.0.omni.tar.gz > > ４．/opt/score/score.sourceでconfigure > > ここで, > % coinfigure --option site > と site ファイルを使用することを教えてあげてください. > あと SCore の下だけ make install しないと /opt/score/* > に反映されません. > Omni の make だけでしたら > /opt/score/lib/build/config/i386-redhat8-linux2_4 > に追加するだけでもよいと思います. > > で, これを行っていないので... > > > # omcc -omniconfig=scash -o laplace_omp laplace_omp.c > > を実施したところ > > omcc -omniconfig=scash -o laplace_omp laplace_omp.c > > Warning: -ms16m not understood. Ignoring. > > Warning: -mx1024m not understood. Ignoring. > > Warning: -o not understood. Ignoring. > > Exception in thread "main" java.lang.InternalError: unexpected exception duri > > ng > > linking: java.lang.ClassNotFoundException: exc.object.XobjectFile > > at 0x4028115f: java.lang.Throwable.Throwable(java.lang.String) (/usr/lib/l > > ibgcj.so.3) > > j2sdk ではなく, /usr/bin にあった gcj を使用しようとしているようです. > > > そこで > > 教えて欲しいのですが、SCore5.4.0のCDに入っているomni openmpと整合性の合うJDK > > は、 > > j2sdk-1.3.1-FCS-linuxで問題ないのでしょうか？ > > 多分問題ないと思います. > ちなみに, SCore 5.4.0 の binarry をつくるときに私用したのは > j2se 1.3.1_02 です. この対処法を実施しました。 その後、Omniのコンパイラテストを行ったのですが、 それでもはやりエラーを出し実行モジュールができませんでした。 Omniのsmake、smake installでJAVAのリンクが原因であろうエラーが出ました。 … creating Cxx-front/Makefile sed: can't read ./Cxx-front/Makefile.in: No such file or directory … creating tests/F-test/Makefile sed: can't read ./tests/F-test/Makefile.in: No such file or directory creating tests/F-test/OMP-test/Makefile sed: can't read ./tests/F-test/OMP-test/Makefile.in: No such file or directory … for i in ./include exc-tools-java/exc lib/libompsm lib/libompc lib/libf2c lib/libtlog lib/runtime C-front Cxx-front F-front tools/driver tools/wrapper tools/tlogview tools/jmpstat tests doc; do \ (cd $i; LANG=C LC_ALL=C make); \ done; rm -f exc.jar (cd object/Xcodegen; make) make[2]: Nothing to be done for `all'. for i in object block openmp util flow tea ../shm ../st ; do \ (cd $i; CLASSPATH=.:..:../..:$CLASSPATH /usr/bin/javac *.java); \ done ./Xcode.java:4: Class `exc.object.Xcode' already defined in Xcode.java:4. public class Xcode { ^ 1 error rm -f exc.jar (cd ../ ; \ rm -f .classes ; \ find ./exc ./shm ./st -name '*.class' -print > .classes ; \ sh ../utils/genjar exc.jar `cat .classes` ; \ mv exc.jar exc ; \ rm -f .classes ;) make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: *** No targets. Stop. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. make[1]: Nothing to be done for `all'. どのように行えば正しくOmni OpenMPコンパイラが インストールすることができるでしょうか？ よろしくお願いいたします。 -- Ritsumeikan Univ. HPC Laboratory Hayashi Masaki hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp From msato ＠ is.tsukuba.ac.jp Thu Jun 17 13:53:25 2004 From: msato ＠ is.tsukuba.ac.jp (Mitsuhisa Sato) Date: Thu, 17 Jun 2004 13:53:25 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] Omni OpenMP Compiler In-Reply-To: <20040617101311.9460.HAYASHI@hpc.cs.ritsumei.ac.jp> References: <20040617101311.9460.HAYASHI@hpc.cs.ritsumei.ac.jp> Message-ID: <20040617.135325.576053362.msato@hpcs.is.tsukuba.ac.jp> From: Hayashi Masaki Subject: [SCore-users-jp] Omni OpenMP Compiler Date: Thu, 17 Jun 2004 13:26:24 +0900 > > j2se 1.3.1_02 です. > この対処法を実施しました。 > その後、Omniのコンパイラテストを行ったのですが、 > それでもはやりエラーを出し実行モジュールができませんでした。 > Omniのsmake、smake installでJAVAのリンクが原因であろうエラーが出ました。 jdkにpathを通してから、configureをやられましたか？ さとう。 > … > creating Cxx-front/Makefile > sed: can't read ./Cxx-front/Makefile.in: No such file or directory なんかこれは、別のものをしているようにみえますが。 From hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp Thu Jun 17 14:01:52 2004 From: hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp (Hayashi Masaki) Date: Thu, 17 Jun 2004 14:01:52 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Omni OpenMP Compiler In-Reply-To: <20040617.135325.576053362.msato@hpcs.is.tsukuba.ac.jp> References: <20040617101311.9460.HAYASHI@hpc.cs.ritsumei.ac.jp> <20040617.135325.576053362.msato@hpcs.is.tsukuba.ac.jp> Message-ID: <20040617135723.9463.HAYASHI@hpc.cs.ritsumei.ac.jp> お世話になっております。 立命館大学の林です。 > > > j2se 1.3.1_02 です. > > この対処法を実施しました。 > > その後、Omniのコンパイラテストを行ったのですが、 > > それでもはやりエラーを出し実行モジュールができませんでした。 > > Omniのsmake、smake installでJAVAのリンクが原因であろうエラーが出ました。 > > jdkにpathを通してから、configureをやられましたか？ > > さとう。 ./configuer --option=site　でpathは反映されてると理解したのですが… 間違っているのでしょうか？ JAVAのPATHは /usr/java/j2sdk1.3.1 です。 > > > … > > creating Cxx-front/Makefile > > sed: can't read ./Cxx-front/Makefile.in: No such file or directory > > なんかこれは、別のものをしているようにみえますが。 -- Ritsumeikan Univ. HPC Laboratory Hayashi Masaki hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp From kameyama ＠ pccluster.org Thu Jun 17 14:05:13 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Thu, 17 Jun 2004 14:05:13 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Omni OpenMP Compiler In-Reply-To: Your message of "Thu, 17 Jun 2004 13:26:24 JST." <20040617101311.9460.HAYASHI@hpc.cs.ritsumei.ac.jp> Message-ID: <20040617045705.371C312894C@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> 亀山です. In article <20040617101311.9460.HAYASHI ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp> Hayashi Masaki wrotes: > Omni OpenMPコンパイラをインストールするためJDKをダウンロードし > # mkdir /usr/java > # cd /usr/java > # tar xjf /opt/score.work/j2sdk-1.3.1-FCS-linux-i386.tar.bz2 > と /usr/java に展開しました。 > そして /opt/score/score-src/adm/config/site ファイルに > JAVA_HOME = /usr/java/j2sdk1.3.1 > JAVA = $(JAVA_HOME)/bin/java > と記入し > # cd /opt/score > # for tarfile in /opt/score.work/*.tar.gz > # do > # tar xzf $tarfile > # done > # cd score-src > # ./configure --option=site > # make > と行い、その他すべての設定をし、通信テストも行いました。 この手順でよさそうな寄がしますが... SUN からとってきた VERSION 1.3.1_02 の rpm は jdk-1.3.1_02.i386.rpm で install path が /usr/java/jdk1.3.1_02/ でした. 今, jdk 1.3.1_12 を落してみましたが, jdk1.3.1_12 になっていました. (file は j2sdk-1_3_1_12-linux-i586.bin) JAVA_HOME = /usr/java/j2sdk1.3.1 は正しいでしょうか? /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/java は存在するでしょうか? > その後、Omniのコンパイラテストを行ったのですが、 > それでもはやりエラーを出し実行モジュールができませんでした。 (中略) > for i in object block openmp util flow tea ../shm ../st ; do \ > (cd $i; CLASSPATH=.:..:../..:$CLASSPATH /usr/bin/javac *.java); \ まだ java compiler として /usr/bin/java を使用しようとしている ようです. もっと上のほうの java 関係の認識はどうなっているでしょうか? その設定ですと, checking for javac... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/javac checking for java... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/java checking for jar... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/jar のようになっているはずなのですが... from Kameyama Toyohisa From kameyama ＠ pccluster.org Thu Jun 17 18:02:06 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Thu, 17 Jun 2004 18:02:06 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Omni OpenMP Compiler In-Reply-To: Your message of "Thu, 17 Jun 2004 14:05:13 JST." <20040617045705.371C312894C@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> Message-ID: <20040617085357.80C2A12894C@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> 亀山です. In article <20040617045705.371C312894C ＠ neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> kameyama ＠ pccluster.org wrotes: > SUN からとってきた VERSION 1.3.1_02 の rpm は jdk-1.3.1_02.i386.rpm > で install path が /usr/java/jdk1.3.1_02/ でした. > 今, jdk 1.3.1_12 を落してみましたが, jdk1.3.1_12 になっていました. > (file は j2sdk-1_3_1_12-linux-i586.bin) > JAVA_HOME = /usr/java/j2sdk1.3.1 > は正しいでしょうか? blackdown 版は j2sdk1.3.1 になっていました. > > for i in object block openmp util flow tea ../shm ../st ; do \ > > (cd $i; CLASSPATH=.:..:../..:$CLASSPATH /usr/bin/javac *.java); \ > > まだ java compiler として /usr/bin/java を使用しようとしている > ようです. こちらでは JAVA_HOME を設定したら, JDK 1.3.1 の javac を 使ってくれました. > もっと上のほうの java 関係の認識はどうなっているでしょうか? > その設定ですと, > > checking for javac... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/javac > checking for java... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/java > checking for jar... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/jar > > のようになっているはずなのですが... できれば, このあたりと, 先頭で omni_make を呼ぶ部分 CPPFLAGS= ./omni_make -compiler $tag -javahome "/usr/java/j2sdk1.3.1" ... の部分がどうなっているか教えていただけないでしょうか? from Kameyama Toyohisa From hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp Thu Jun 17 18:24:27 2004 From: hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp (Hayashi Masaki) Date: Thu, 17 Jun 2004 18:24:27 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Omni OpenMP Compiler In-Reply-To: <20040617085357.80C2A12894C@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> References: <20040617045705.371C312894C@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> <20040617085357.80C2A12894C@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> Message-ID: <20040617181410.9465.HAYASHI@hpc.cs.ritsumei.ac.jp> 亀山様 お世話になっております。 立命館大学の林です。 ご指導ありがとうございます。 /opt/omni/を削除し始めからコンパイルをし直したところ 正常にインストールできたようです。 お騒がせして申し訳ございませんでした。。。 Omni OpenMPコンパイラのテストをしたところ # omcc -omniconfig=scash pi.c Compiling 'pi.c'... /opt/score/lib/i386-redhat8-linux2_4/libscash.a(scash_etc.o): In function `scash_fatal': scash_etc.o(.text+0x2d): `sys_errlist' is deprecated; use `strerror' or `strerror_r' instead /opt/score/lib/i386-redhat8-linux2_4/libpm.a(pm.o): In function `pmErrorString': /opt/score/score-src/SCore/pm2/common/obj.i386-redhat8-linux2_4/../pm.c:495: `sys_nerr' is deprecated; use `strerror' or `strerror_r' instead # とエラーを吐かれました。 これはScashがEnableされてないということでしょうか？ scashをEnableするには /opt/score/で ./configure --enable-scash すればよいのでしょうか？ もう一度コンパイルする必要があるのでしょうか？ 質問がゴッチャになってしまい申し訳ございません。 > 亀山です. > > In article <20040617045705.371C312894C ＠ neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> kameyama ＠ pccluster.org wrotes: > > SUN からとってきた VERSION 1.3.1_02 の rpm は jdk-1.3.1_02.i386.rpm > > で install path が /usr/java/jdk1.3.1_02/ でした. > > 今, jdk 1.3.1_12 を落してみましたが, jdk1.3.1_12 になっていました. > > (file は j2sdk-1_3_1_12-linux-i586.bin) > > JAVA_HOME = /usr/java/j2sdk1.3.1 > > は正しいでしょうか? > > blackdown 版は j2sdk1.3.1 になっていました. > > > > for i in object block openmp util flow tea ../shm ../st ; do \ > > > (cd $i; CLASSPATH=.:..:../..:$CLASSPATH /usr/bin/javac *.java); \ > > > > まだ java compiler として /usr/bin/java を使用しようとしている > > ようです. > > こちらでは JAVA_HOME を設定したら, JDK 1.3.1 の javac を > 使ってくれました. > > > もっと上のほうの java 関係の認識はどうなっているでしょうか? > > その設定ですと, > > > > checking for javac... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/javac > > checking for java... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/java > > checking for jar... /usr/java/j2sdk1.3.1/bin/jar > > > > のようになっているはずなのですが... > > できれば, このあたりと, 先頭で omni_make を呼ぶ部分 > CPPFLAGS= ./omni_make -compiler $tag -javahome "/usr/java/j2sdk1.3.1" ... > の部分がどうなっているか教えていただけないでしょうか? > > from Kameyama Toyohisa -- Ritsumeikan Univ. HPC Laboratory Hayashi Masaki hayashi ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp From kameyama ＠ pccluster.org Thu Jun 17 18:30:34 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Thu, 17 Jun 2004 18:30:34 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Omni OpenMP Compiler In-Reply-To: Your message of "Thu, 17 Jun 2004 18:24:27 JST." <20040617181410.9465.HAYASHI@hpc.cs.ritsumei.ac.jp> Message-ID: <20040617092225.63F7712894C@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> 亀山です. In article <20040617181410.9465.HAYASHI ＠ hpc.cs.ritsumei.ac.jp> Hayashi Masaki wrotes: > Omni OpenMPコンパイラのテストをしたところ > # omcc -omniconfig=scash pi.c > Compiling 'pi.c'... > /opt/score/lib/i386-redhat8-linux2_4/libscash.a(scash_etc.o): In function `sc > ash_fatal': > scash_etc.o(.text+0x2d): `sys_errlist' is deprecated; use `strerror' or `stre > rror_r' instead > /opt/score/lib/i386-redhat8-linux2_4/libpm.a(pm.o): In function `pmErrorStrin > g': > /opt/score/score-src/SCore/pm2/common/obj.i386-redhat8-linux2_4/../pm.c:495: > `sys_nerr' is deprecated; use `strerror' or `strerror_r' instead > # > とエラーを吐かれました。 これは無視してください. (SCore の通信ライブラリ PM で sys_errlist, sys_nerr を使用しているのですが, 使うなといわれてしまっているわけで...) これで正常です. 多分, a.out ができていると思いますので, それを 動かしてみてください. from Kameyama Toyohisa From kameyama ＠ pccluster.org Mon Jun 21 20:34:03 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Mon, 21 Jun 2004 20:34:03 +0900 Subject: [SCore-users-jp] [SCore-users] Re: scrun and dynamically linked executable In-Reply-To: Your message of "Thu, 17 Jun 2004 15:39:17 JST." <00e801c45470$7c936000$1c11a8c0@moloss> Message-ID: <20040621112541.6DBB2128955@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> In article <00e801c45470$7c936000$1c11a8c0 ＠ moloss> "laurent duhem" wrotes: > Thanks for your prompt support. > I am though a bit puzzled with your answer. > > Is there a way to tell compute nodes where to look for dynamic > dependencies? > Please edit /etc/ld.so.conf on the compute hosts. > > Fine. > > So I need root credential if I want to run applications linked against > dynamic libraries on a Score Cluster !! > > What is more, what if names of dynamic libraries are the same from one > application to another, or worse from one application to the system ? > > Example : my application has a dynamic library named libuser.so. How can = > I > configure compute nodes then ? (/usr/lib/libuser.so is part of Linux > distrib). On SCore 5.6, this program cannot run. > I can only figure out to write into the executable where to look for = > dynamic > dependencies (-rpath or equivalent), but in this case my product will = > have > to install always in a fixed location !! > > =20 > > If everything I say is true (I am waiting for you to prove me I am wrong > :-)), do you really think this is an acceptable industrial behaviour, = > for > big software editors ?. > > What is more, Score 5.4 did export LD_LIBRARY_PATH, so why this = > regression?. On SCore 5.4 and older, scrun program is statically linked. But the scrun cause segment falt on redhat 8 and use netgroup. So on SCore 5.6, scrun link dynamically. But on redhat 7.3 or before LD_LIBRARY_PATH unexport setuid and dynamic link program. So On redhat 7.3 and SCore 5.4, LD_LIBRARY_PATH is exported. But redhat 8.0 or SCore 5.6, LD_LIBRARY_PATH is not exported. We will exported LD_LIBRARY_PATH again on next release. from Kameyama Toyohisa _______________________________________________ SCore-users mailing list SCore-users ＠ pccluster.org http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users From k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Tue Jun 22 10:35:18 2004 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com (=?iso-2022-jp?b?ay1pa2VnYW1pIBskQiF3GyhCIGFqLmpwLm5lYy5jb20=?=) Date: Tue, 22 Jun 2004 10:35:18 +0900 Subject: [SCore-users-jp] OpenMPでのスタック Message-ID: <20040622103518k-ikegami@mail.jp.nec.com> 池上と申します。 OmniOpenMP環境、２×２の環境にてＡＰを走らせると、数時間後にプログラムがスタックします。 走らせていると、途中で 　<0> SCORE WARNING: Physical memory might be exhausted. の表示が出て、本表示の数時間後にスタックしました。 少し前に本MLで話題に”おせっかいメッセージとして”話題に上っていたので、直接原因では ないのかな？と考えています。 （スタックしたときにfreeコマンドで見てもswapを使い果たしていませんでした。） ｐｓで見るとプロセスは生きているので、ＧＤＢでバックトレースしてみると、 下記の様に、３，４番目のノードでシグナルハンドラが呼ばれていました。１，２番目のノードは バリア同期待ちのようです。 同じプログラムを１×２環境（１プロセッサ２ＣＰＵ）で走らせると、１日経過しても症状は発生しません。 シグナルハンドラが呼ばれているUser_Function_1を徹底的にデバッグしましたが、特に問題になり そうなコードを発見できない状況です。 ハンドラが呼ばれるという観点から、どなたかこのような経験をお持ちの方、解決のヒントをお持ちの方 がいらっしゃいましたら、ご教授いただけないでしょうか？ 以下は、スタック時のバックトレースです。 Node-1: (gdb) bt #0 0x080ddd94 in ioctl () #1 0x40073000 in ?? () #2 0x0808ca2d in comp_receive () #3 0x08076fb2 in scash_message_recv () #4 0x0807333c in scash_barrier_a2a () #5 0x08073e56 in scash_barrier () #6 0x0806fcca in _ompsm_scash_master_end () #7 0x0806c684 in _ompc_do_parallel_if () #8 0x0806c703 in _ompc_do_parallel () #9 0x08062fa1 in Moni_CalcMain () #10 0x0805e011 in Moni_GetEvent () #11 0x0806650a in _ompc_main () #12 0x0806bf79 in main () Node-2: (gdb) bt #0 0x080ddd94 in ioctl () #1 0x400b9000 in ?? () #2 0x0808ca2d in comp_receive () #3 0x08076fb2 in scash_message_recv () #4 0x0807333c in scash_barrier_a2a () #5 0x08073e56 in scash_barrier () #6 0x0806fce2 in _ompsm_scash_slave_end () #7 0x0806c505 in _ompsm_slave_main () #8 0x0806fc83 in _ompsm_scash_slave_wrapper () #9 0x0806fc3d in _ompsm_scash_init () #10 0x0806bfdf in _ompc_init () #11 0x0806bf9e in _ompsm_init () #12 0x0806bf72 in main () #13 0x080c0806 in __libc_start_main () Node-3: (gdb) bt #0 0x080ddd94 in ioctl () #1 0x40073000 in ?? () #2 0x0808ca8d in comp_receive () #3 0x08076fb2 in scash_message_recv () #4 0x0807872b in scash_page_rma_copy () #5 0x08076385 in scash_vm_handler () #6 #7 0x08064100 in User_Function_1 () #8 0x08062711 in __ompc_func_3 () #9 0x0806c4fb in _ompsm_slave_main () #10 0x0806fc83 in _ompsm_scash_slave_wrapper () #11 0x0806fc3d in _ompsm_scash_init () #12 0x0806bfdf in _ompc_init () #13 0x0806bf9e in _ompsm_init () #14 0x0806bf72 in main () #15 0x080c0806 in __libc_start_main () Node-4: (gdb) bt #0 0x080ddd94 in ioctl () #1 0x400b9000 in ?? () #2 0x0808ca8d in comp_receive () #3 0x08076fb2 in scash_message_recv () #4 0x0807872b in scash_page_rma_copy () #5 0x08076385 in scash_vm_handler () #6 #7 0x08063e94 in User_Function_1 () #8 0x08062711 in __ompc_func_3 () #9 0x0806c4fb in _ompsm_slave_main () #10 0x0806fc83 in _ompsm_scash_slave_wrapper () #11 0x0806fc3d in _ompsm_scash_init () #12 0x0806bfdf in _ompc_init () #13 0x0806bf9e in _ompsm_init () #14 0x0806bf72 in main () #15 0x080c0806 in __libc_start_main () /*----------------------------------------------*/ // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 From kameyama ＠ pccluster.org Wed Jun 23 15:01:54 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Wed, 23 Jun 2004 15:01:54 +0900 Subject: [SCore-users-jp] OpenMPでのスタック In-Reply-To: Your message of "Tue, 22 Jun 2004 10:35:18 JST." <20040622103518k-ikegami@mail.jp.nec.com> Message-ID: <20040623055326.F2FAE12894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> 亀山です. In article <20040622103518k-ikegami ＠ mail.jp.nec.com> k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com wrotes: > 走らせていると、途中で > 　<0> SCORE WARNING: Physical memory might be exhausted. > の表示が出て、本表示の数時間後にスタックしました。 > 少し前に本MLで話題に”おせっかいメッセージとして”話題に上っていたので、直接 > 原因では > ないのかな？と考えています。 > （スタックしたときにfreeコマンドで見てもswapを使い果たしていませんでした。） よくわかっていませんが, memory が swap している状態で SCASH を使うのが問題なのかもしれません. > ｐｓで見るとプロセスは生きているので、ＧＤＢでバックトレースしてみると、 > 下記の様に、３，４番目のノードでシグナルハンドラが呼ばれていました。１，２番 > 目のノードは > バリア同期待ちのようです。 > 同じプログラムを１×２環境（１プロセッサ２ＣＰＵ）で走らせると、１日経過して > も症状は発生しません。 > > シグナルハンドラが呼ばれているUser_Function_1を徹底的にデバッグしましたが、特 > に問題になり > そうなコードを発見できない状況です。 User_Function_1 で signal handler が呼ばれていること自体は問題ありません. OpenMP では共有メモリを前提としているのですが, 当然, cluster を構成する host 間は, memory を共有できません. そのため, 共有すべきページがその host にない場合, 別のホストからコピーしてくる必要があります. SCASH では, そのページがホストにないことを SIGSEGV シグナルで検出し, scash_vm_handler() を呼び出し, scash_page_rma_copy() で, 別の host からそのページを持ってきます. と, いうことで, OpenMP/SCASH を使用している場合, scash_vm_handler() が呼ばれているのは特別なことではなく, 正常な動作です. で, そのページが相手の host にあればよいのですが, swap out していると危ないのかも... from Kameyama Toyohisa From k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Wed Jun 23 15:40:17 2004 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com (=?iso-2022-jp?b?ay1pa2VnYW1pIBskQiF3GyhCIGFqLmpwLm5lYy5jb20=?=) Date: Wed, 23 Jun 2004 15:40:17 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: [SCore-users-jp]OpenMPでのスタック In-Reply-To: <20040623055326.F2FAE12894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> References: <20040623055326.F2FAE12894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> Message-ID: <20040623154017k-ikegami@mail.jp.nec.com> 亀山様 池上です。レスポンスありがとうございます。 >User_Function_1 で signal handler が呼ばれていること自体は問題ありません. 理解いたしました。ハンドラというと、すぐに例外ハンドラをイメージしてしまうもので、 勘違いしていました。 > >で, そのページが相手の host にあればよいのですが, swap out >していると危ないのかも... ノード間でシェアしているテーブル（変数）は、物理メモリにピンダウンされる と理解しているのですが、 　<0> SCORE WARNING: Physical memory might be exhausted. のメッセージが出ると、そのテーブルも保証されずにスワップされる可能性があるという ことなのでしょうか？ 教授いただければ幸いです。 /*----------------------------------------------*/ // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 From kameyama ＠ pccluster.org Wed Jun 23 17:27:46 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Wed, 23 Jun 2004 17:27:46 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re: [SCore-users-jp]OpenMPでのスタック In-Reply-To: Your message of "Wed, 23 Jun 2004 15:40:17 JST." <20040623154017k-ikegami@mail.jp.nec.com> Message-ID: <20040623081918.9D38912894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> 亀山です. In article <20040623154017k-ikegami ＠ mail.jp.nec.com> k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com wrotes: > ノード間でシェアしているテーブル（変数）は、物理メモリにピンダウンされる > と理解しているのですが、 そうですね. 前の mail は間違いでした. ところで, どれくらい memory を持っていて どれくらい swap されているのでしょうか? あと, 参考までに host 間の通信は何を使用しているでしょうか? from Kameyama Toyohisa From k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Wed Jun 23 18:12:27 2004 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com (=?iso-2022-jp?b?ay1pa2VnYW1pIBskQiF3GyhCIGFqLmpwLm5lYy5jb20=?=) Date: Wed, 23 Jun 2004 18:12:27 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re:[SCore-users-jp]OpenMPでのスタック In-Reply-To: <20040623081918.9D38912894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> References: <20040623081918.9D38912894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> Message-ID: <20040623181227k-ikegami@mail.jp.nec.com> 亀山様 池上です。いろいろありがとうございます。 > >ところで, どれくらい memory を持っていて >どれくらい swap されているのでしょうか? >あと, 参考までに host 間の通信は何を使用しているでしょうか? 物理メモリ：１ＧＢｙｔｅ ＳＷＡＰ　：２ＧＢｙｔｅ スタック後にｖｍｓｔａｔで状況を確認したところ、 ＳＷＡＰ使用＝２８６ＭＢｙｔｅでした。 常時スワップが発生しているので、物理メモリが絶対的に少ないことは 理解しているのですが、増設するにしても、本現象がメモリ不足が原因か 否かの特定をしたいので。。 尚、ネットワークは、下記のギガビットイーサを使用しており、プロセッサに ２つのＮＩＣを差し、ＳＣｏｒｅ用とその他（計算結果の送信）用に分けています。 プロセッサ　NEC Express5800/120Rd-1 ＮＩＣ×２：チップ　Intel 82546EB 　　　　　　ドライバ　e1000（5.2.16） 以上、よろしくお願いいたします。 /*----------------------------------------------*/ // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 From g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp Wed Jun 23 23:58:38 2004 From: g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp (Setsuo AOKI) Date: Wed, 23 Jun 2004 23:58:38 +0900 Subject: [SCore-users-jp] ディスクレスクラスタ Message-ID: 青木です。 　 http://mikilab.doshisha.ac.jp/dia/research/report/2004/0610/003/report200406 10003.html ↑このページでSCoreはディスクレスクラスタを作成することはできないとあるので すが これはSCoreの仕様から出来ないのでしょうか？それとも実装されていないだけで ディスクレスクラスタは構築可能なのでしょうか？ よろしくおねがいしますm(__)m --- 武蔵工業大学電子情報工学科４年 青木節夫（あおき　せつお） From fumiyosi ＠ hiroshima-u.ac.jp Thu Jun 24 00:34:50 2004 From: fumiyosi ＠ hiroshima-u.ac.jp (Fumiyoshi Shoji) Date: Thu, 24 Jun 2004 00:34:50 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] ディスクレスクラスタ In-Reply-To: References: Message-ID: <20040624.003450.74750192.fumiyosi@hiroshima-u.ac.jp> 広島大メディアセンターの庄司と申します。 From: "Setsuo AOKI" Subject: [SCore-users-jp] ディスクレスクラスタ Date: Wed, 23 Jun 2004 23:58:38 +0900 > 青木です。 > > 　 > http://mikilab.doshisha.ac.jp/dia/research/report/2004/0610/003/report200406 > 10003.html > ↑このページでSCoreはディスクレスクラスタを作成することはできないとあるので > すが > これはSCoreの仕様から出来ないのでしょうか？それとも実装されていないだけで > ディスクレスクラスタは構築可能なのでしょうか？ > よろしくおねがいしますm(__)m > > --- > 武蔵工業大学電子情報工学科４年 > 青木節夫（あおき　せつお） > > _______________________________________________ > SCore-users-jp mailing list > SCore-users-jp ＠ pccluster.org > http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users-jp > SCore の詳しい仕様については良くわかっていないので、開発者の方にお答えい ただければと思いますが、 事例として、我々のセンターでは、教育用PC端末をSCore でディスクレスクラス タとして構築し、利用しています。 ただ、SCore の仕様として /var/scored はローカルに無いとダメと聞いたので、 ここだけは各端末のローカルディスクに領域を確保しています。ですので、正確 にはディスクレスではありません。 ご参考までに。 -------------------------------------------- 広島大学 情報メディア教育研究センター 庄司 文由 (Shoji, Fumiyoshi) E-mail. fumiyosi ＠ hiroshima-u.ac.jp 〒739-8511 東広島市鏡山1丁目 4-2 Tel. 082-424-6991(ダイヤルイン)6252(事務室) FAX. 082-422-7043 -------------------------------------------- From msato ＠ is.tsukuba.ac.jp Thu Jun 24 03:14:35 2004 From: msato ＠ is.tsukuba.ac.jp (Mitsuhisa Sato) Date: Thu, 24 Jun 2004 03:14:35 +0900 (JST) Subject: [SCore-users-jp] Re:[SCore-users-jp]OpenMPでのスタック In-Reply-To: <20040623181227k-ikegami@mail.jp.nec.com> References: <20040623081918.9D38912894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> <20040623181227k-ikegami@mail.jp.nec.com> Message-ID: <20040624.031435.884044064.msato@hpcs.is.tsukuba.ac.jp> 池上様、 多分、実メモリがたりないのではないかとおもいます。 現在のOmni/SCASHでは、共有するメモリは全てpin-downしてなくてはならない、 すなわち、物理メモリがなくてはなりません。 実際に大きな問題に適用しようとおもうとこの問題は深刻な問題になります。 いま、開発を進めている次のversionではこれを解決する見込みですが、... とりいそぎ。 さとう。 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Subject: [SCore-users-jp] Re:[SCore-users-jp]OpenMPでのスタック Date: Wed, 23 Jun 2004 18:12:27 +0900 > 亀山様 > > 池上です。いろいろありがとうございます。 > > > > >ところで, どれくらい memory を持っていて > >どれくらい swap されているのでしょうか? > >あと, 参考までに host 間の通信は何を使用しているでしょうか? > > 物理メモリ：１ＧＢｙｔｅ > ＳＷＡＰ　：２ＧＢｙｔｅ > > スタック後にｖｍｓｔａｔで状況を確認したところ、 > ＳＷＡＰ使用＝２８６ＭＢｙｔｅでした。 > > 常時スワップが発生しているので、物理メモリが絶対的に少ないことは > 理解しているのですが、増設するにしても、本現象がメモリ不足が原因か > 否かの特定をしたいので。。 > > 尚、ネットワークは、下記のギガビットイーサを使用しており、プロセッサに > ２つのＮＩＣを差し、ＳＣｏｒｅ用とその他（計算結果の送信）用に分けています。 > > プロセッサ　NEC Express5800/120Rd-1 > ＮＩＣ×２：チップ　Intel 82546EB > 　　　　　　ドライバ　e1000（5.2.16） > > > 以上、よろしくお願いいたします。 > > /*----------------------------------------------*/ > // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com > // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 > // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 > _______________________________________________ > SCore-users-jp mailing list > SCore-users-jp ＠ pccluster.org > http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users-jp > From kameyama ＠ pccluster.org Thu Jun 24 09:38:40 2004 From: kameyama ＠ pccluster.org (=?iso-2022-jp?b?a2FtZXlhbWEgGyRCIXcbKEIgcGNjbHVzdGVyLm9yZw==?=) Date: Thu, 24 Jun 2004 09:38:40 +0900 Subject: [SCore-users-jp] ディスクレスクラスタ In-Reply-To: Your message of "Thu, 24 Jun 2004 00:34:50 JST." <20040624.003450.74750192.fumiyosi@hiroshima-u.ac.jp> Message-ID: <20040624003009.9C19912894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> 亀山です. In article <20040624.003450.74750192.fumiyosi ＠ hiroshima-u.ac.jp> Fumiyoshi Shoji wrotes: > > http://mikilab.doshisha.ac.jp/dia/research/report/2004/0610/003/report20040610003.html > > ↑このページでSCoreはディスクレスクラスタを作成することはできないとあるので > > すが > > これはSCoreの仕様から出来ないのでしょうか？それとも実装されていないだけで > > ディスクレスクラスタは構築可能なのでしょうか？ なんか, この文章では EIT (上記 URL では EIV になっていますが...) と SCore の話がごっちゃになっている (というか, 主旨は EIT と DCAST の比較ですね.) そういう意味では EIT で diskless cluster を作成することはできません. > ただ、SCore の仕様として /var/scored はローカルに無いとダメと聞いたので、 > ここだけは各端末のローカルディスクに領域を確保しています。ですので、正確 > にはディスクレスではありません。 /var/scored はそのクラスタ固有の情報が格納されるので, (仕様としては, 共有できないものをここに集めているのですが...) 共有することはできません. ただ, 共有しなけてば, NFS でも大丈夫かもしれません. ただ, SCore ではプログラムを実行するのに, binary を一度 /var/scored の下にコピーしてから行うようになっていますので, 無駄なトラフィックが増えるだけなので, お薦めできませんけど... from Kameyama Toyohisa From nakata ＠ bestsystems.co.jp Thu Jun 24 09:45:33 2004 From: nakata ＠ bestsystems.co.jp (Hisaho Nakata) Date: Thu, 24 Jun 2004 09:45:33 +0900 Subject: [SCore-users-jp] ディスクレスクラスタ In-Reply-To: <20040624003009.9C19912894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> References: <20040624.003450.74750192.fumiyosi@hiroshima-u.ac.jp> <20040624003009.9C19912894E@neal.il.is.s.u-tokyo.ac.jp> Message-ID: <20040624094533.7a1aca72.nakata@bestsystems.co.jp> 中田＠ベストシステムズです。 > ↑このページでSCoreはディスクレスクラスタを作成することはできないとあるので > すが > これはSCoreの仕様から出来ないのでしょうか？それとも実装されていないだけで > ディスクレスクラスタは構築可能なのでしょうか？ ディスクレスとはちょっと違いますが、CD-ROMブートのLinuxでSCoreを動かした例は あります。 http://miko.gnyo.org/about.html From k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com Thu Jun 24 11:32:29 2004 From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com (=?iso-2022-jp?b?ay1pa2VnYW1pIBskQiF3GyhCIGFqLmpwLm5lYy5jb20=?=) Date: Thu, 24 Jun 2004 11:32:29 +0900 Subject: [SCore-users-jp] Re:[SCore-users-jp]OpenMPでのスタック In-Reply-To: <20040624.031435.884044064.msato@hpcs.is.tsukuba.ac.jp> References: <20040624.031435.884044064.msato@hpcs.is.tsukuba.ac.jp> Message-ID: <20040624113229k-ikegami@mail.jp.nec.com> 佐藤様 亀山様 池上です。 やはり、メモリ不足ですか。 メモリ不足の場合に、プロセスが終了せずにノード間通信待ちのような 状態でスタックするという動きが釈然としない(注１）のですが、とりあえず メモリを増やして試してみます。（アプリのバグかな？） （注１）メモリを意図的に少しずつ食いつぶすプログラムを並行して動かしたところ、 　　　　プロセス終了したため。 ありがとうございました。 2004/06/24 03:14:35 +0900にMitsuhisa Sato さんに頂いた 「Re: [SCore-users-jp] Re:[SCore-users-jp]OpenMPでのスタック」への返事です。 >池上様、 >多分、実メモリがたりないのではないかとおもいます。 >現在のOmni/SCASHでは、共有するメモリは全てpin-downしてなくてはならない、 >すなわち、物理メモリがなくてはなりません。 > >実際に大きな問題に適用しようとおもうとこの問題は深刻な問題になります。 >いま、開発を進めている次のversionではこれを解決する見込みですが、... > >とりいそぎ。 >さとう。 > >From: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com >Subject: [SCore-users-jp] Re:[SCore-users-jp]OpenMPでのスタック >Date: Wed, 23 Jun 2004 18:12:27 +0900 > >> 亀山様 >> >> 池上です。いろいろありがとうございます。 >> >> > >> >ところで, どれくらい memory を持っていて >> >どれくらい swap されているのでしょうか? >> >あと, 参考までに host 間の通信は何を使用しているでしょうか? >> >> 物理メモリ：１ＧＢｙｔｅ >> ＳＷＡＰ　：２ＧＢｙｔｅ >> >> スタック後にｖｍｓｔａｔで状況を確認したところ、 >> ＳＷＡＰ使用＝２８６ＭＢｙｔｅでした。 >> >> 常時スワップが発生しているので、物理メモリが絶対的に少ないことは >> 理解しているのですが、増設するにしても、本現象がメモリ不足が原因か >> 否かの特定をしたいので。。 >> >> 尚、ネットワークは、下記のギガビットイーサを使用しており、プロセッサに >> ２つのＮＩＣを差し、ＳＣｏｒｅ用とその他（計算結果の送信）用に分けています。 >> >> プロセッサ　NEC Express5800/120Rd-1 >> ＮＩＣ×２：チップ　Intel 82546EB >> 　　　　　　ドライバ　e1000（5.2.16） >> >> >> 以上、よろしくお願いいたします。 >> >> /*----------------------------------------------*/ >> // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com >> // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 >> // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 >> _______________________________________________ >> SCore-users-jp mailing list >> SCore-users-jp ＠ pccluster.org >> http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users-jp >> >_______________________________________________ >SCore-users-jp mailing list >SCore-users-jp ＠ pccluster.org >http://www.pccluster.org/mailman/listinfo/score-users-jp /*----------------------------------------------*/ // 池上　光太郎　e-mail: k-ikegami ＠ aj.jp.nec.com // TEL : 042-333-5470 FAX : 042-333-5267 // 日本電気株式会社 電波応用事業部 航空システム部 From g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp Thu Jun 24 16:31:27 2004 From: g0115001 ＠ sc.musashi-tech.ac.jp (Setsuo AOKI) Date: Thu, 24 Jun 2004 16:31:27 +0900 Subject: [SCore-users-jp] ディスクレスクラスタ In-Reply-To: <20040624094533.7a1aca72.nakata@bestsystems.co.jp> Message-ID: <20040624073043.120BB1EB399@ceres.lb.ipc.musashi-tech.ac.jp> 青木です。 　みなさまご返答ありがとうございます。 とても参考になりました。 ＃ miko GNYO/Linuxは試したことがあるんですが ＃ うまく動かなかったんです・・・ ------ 武蔵工業大学工学部電子情報工学科 青木　節夫（あおき　せつお） From websitepositioning ＠ ligne-net.info Wed Jun 30 03:30:51 2004 From: websitepositioning ＠ ligne-net.info (Tyler Peterson) Date: Tue, 29 Jun 2004 11:30:51 -0700 Subject: [SCore-users-jp] website referrals Message-ID: <200406291829.i5TITHX32151@pccluster.org> Our company will now position any qualified website above all others for their search results. 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